用微阵列数据检测差异表达基因。该封装可用于cDNA微阵列或Affymetrix芯片。该包适合一个健壮的贝叶斯层次模型,用于测试差异表达。异常值使用$t$-分布显式建模。该模型包括一个可交换的先验方差,允许不同的方差的基因,但仍然收缩极端的经验方差。我们的模型可以用于检测多个样本之间的差异表达基因,并且可以在有三个或更多样本时区分不同可能的差异表达模式。采用一种新的马尔可夫链蒙特卡罗方法进行参数估计,该方法适用于模型在全参数空间的子空间上进行质量估计。
作者 | 拉斐尔Gottardo |
维护人员 | 拉斐尔Gottardo |
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