差异基因表达的贝叶斯鲁棒推理

用微阵列数据检测差异表达基因。该封装可用于cDNA微阵列或Affymetrix芯片。该包适合一个健壮的贝叶斯层次模型,用于测试差异表达。异常值使用$t$-分布显式建模。该模型包括一个可交换的先验方差,允许不同的方差的基因,但仍然收缩极端的经验方差。我们的模型可以用于检测多个样本之间的差异表达基因,并且可以在有三个或更多样本时区分不同可能的差异表达模式。采用一种新的马尔可夫链蒙特卡罗方法进行参数估计,该方法适用于模型在全参数空间的子空间上进行质量估计。

作者 拉斐尔Gottardo
维护人员 拉斐尔Gottardo

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“桥”)

小插曲(文档)

包下载

bridge.pdf
bridge_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 bridge_1.10.0.zip
OS X的二进制 bridge_1.10.0.tgz

细节

biocViews
取决于 R,罗摩
建议
进口
SystemRequirements
许可证 GPL版本2或更新
URL
dependsOnMe
suggestsMe