affxparser

Affymetrix文件解析SDK

软件包解析Affymetrix文件(CDF, CEL, CHP, BPMAP, BAR)。它提供了方法,快速和内存有效的解析Affymetrix文件使用Affymetrix的Fusion SDK。ASCII和二进制文件都受支持。目前,有读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以全部或部分读取。例如,可以非常迅速地从一组CEL文件中提取来自少数探测集的探测信号到一个方便的列表结构中。

作者 亨里克·本特森,詹姆斯·布拉德,卡斯珀·丹尼尔·汉森
维护人员 Kasper丹尼尔·汉森

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affxparser”)

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affxparser_1.10.2.tar.gz
Windows二进制 affxparser_1.10.2.zip
OS X的二进制 affxparser_1.10.2.tgz

细节

biocViews
取决于 R
建议 R.utils, AffymetrixDataTestFiles
进口
SystemRequirements
许可证 LGPL-2
URL
dependsOnMe 低聚糖,pdInfoBuilder
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