| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| ACME | 肖恩·戴维斯 | 算法计算微阵列浓缩(ACME) |
| adSplit | 克劳迪奥·Lottaz | 注解驱动的集群 |
| AffyExpress | Xuejun阿瑟·李 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | GUI使用limma affy分析包 |
| BeadExplorer | 加雷斯·维奇 | QC、正常化、注释和探索Illumina公司BeadChip数据 |
| bgafun | 伊恩•华莱士 | BGAfun方法识别specifity确定残留的蛋白质家族 |
| bgx | 欧内斯特Turro | 贝叶斯基因表达 |
| Biobase | Biocore团队c / o BioC用户列表 | Bioconductor Biobase:基函数 |
| bioDist | Biocore团队c / o BioC用户列表 | 不同距离的措施 |
| Biostrings | h .页面 | 字符串对象代表生物序列,和匹配算法 |
| 桥 | 拉斐尔Gottardo | 贝叶斯强劲的推理微分基因表达 |
| 类别 | 罗伯特先生 | 类别分析 |
| clusterStab | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 计算集群稳定微阵列数据的分数 |
| CoCiteStats | r .绅士 | 基于co-citation不同的测试数据。 |
| 国王杯 | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 函数来执行癌症离群值剖面分析。 |
| CORREP | Dongxiao朱 | 多变量相关性估计和统计推断过程。 |
| 科兹摩 | 奥利弗Bembom | 监督检测DNA序列的守恒的图案 |
| cosmoGUI | 奥利弗Bembom | 所使用的GUI构建约束集cosmo包 |
| ctc | 安东尼·卢卡斯 | 集群和树转换。 |
| daMA | Jobst Landgrebe | 高效的阶乘双色设计和分析微阵列数据 |
| DEDS | 肖渊源 | 微分表达式通过距离微阵列数据的总结 |
| diffGeneAnalysis | Choudary Jagarlamudi | 执行差异基因表达分析 |
| edd | 文斯凯里 | 表达密度诊断 |
| exonmap | Crispin米勒 | 高水平的分析Affymetrix外显子数组的数据 |
| factDesign | 丹尼斯Scholtens | 的阶乘设计微阵列实验分析 |
| fdrame | 有效率切尼克斯贝格 | 罗斯福调整微阵列实验(FDR-AME) |
| genefilter | Biocore团队c / o BioC用户列表 | genefilter:筛选基因微阵列实验的方法 |
| GeneMeta | Biocore团队c / o BioC用户列表 | MetaAnalysis为高通量实验 |
| geneRecommender | 格雷格已经 | 一个基因推荐算法来识别基因coexpressed与查询的一组基因 |
| 麝猫 | Korbinian Strimmer | 微阵列时间序列和网络分析 |
| GGtools | 文斯凯里 | 软件和数据起源的基因组学(c) 2006 VJ凯莉 |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算全球测试组间差异基因表达 |
| globaltest | Jelle Goeman | 测试协会组织的基因与临床变量 |
| GOstats | 罗伯特先生 | 去微阵列的操作工具。 |
| gpl | Biocore团队c / o BioC用户列表 | 使用广义偏最小二乘回归分类 |
| GraphAT | 托马斯LaFramboise | 图理论协会测试 |
| GSEABase | Biocore团队c / o BioC用户列表 | 基因集富集的数据结构和方法 |
| 哼哼 | HyungJun曹 | 非均匀误差模型在多种条件下的差异表达基因的识别 |
| hopach | 凯瑟琳·s·波拉德 | 分层要求分区和混合(HOPACH)崩溃 |
| Icens | Biocore团队c / o BioC用户列表 | NPMLE审查和截断数据 |
| 嫁祸于 | Balasubramanian纳史木汗 | 转嫁:微阵列数据的归责 |
| lapmix | Yann Ruffieux | 拉普拉斯混合模型在微阵列实验 |
| LBE | 西里尔Dalmasso | 错误发现率的估计。 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | GUI对limma包 |
| LMGene | 约翰·蒂 | LMGene日期转换软件和识别差异表达基因的基因表达的数组 |
| logicFS | Holger Schwender | 识别SNP的交互 |
| 简述 | Nitin耆那教徒的 | 方法分析微阵列数据使用本地集中错误(简述)方法 |
| maanova | Hyuna杨 | 分析微阵列实验的工具 |
| macat | Joern Toedling | 微阵列染色体分析工具 |
| made4 | Aedin Culhane | 使用ADE4微阵列数据的多变量分析 |
| maigesPack | 古斯塔沃·h·斯特维斯 | 函数来处理互补脱氧核糖核酸微阵列数据,包括一些数据分析的方法 |
| MantelCorr | 布莱恩Steinmeyer | 曼特尔计算集群的相关性 |
| maSigPro | 安娜Conesa | 显著的基因表达谱在时间进程Differeneces微阵列数据 |
| MCRestimate | 马库斯Ruschhaupt | 用交叉验证错误分类误差估计 |
| MeasurementError.cor | 坞城叮 | 测量误差模型相关系数的估计 |
| MergeMaid | 于宁波钟 | 合并女仆 |
| metaArray | 遭受崔 | 集成微阵列数据的荟萃分析 |
| Mfuzz | 马提亚Futschik | 软聚类时间序列基因表达数据 |
| MiPP | Sukwoo金 | 误分类处罚后分类 |
| MLInterfaces | 诉凯利 | 统一的接口在Bioconductor R机器学习程序数据容器 |
| 乘 | 凯瑟琳·s·波拉德 | Resampling-based多重假设检验 |
| nem | Florian Markowetz | 嵌套的效应模型重建表型层次结构 |
| OCplus | 亚历山大plone ( | 操作特征以及样本容量和本地罗斯福微阵列实验 |
| oneChannelGUI | 拉斐尔一Calogero | 这个包扩展affylmGUI图形界面的功能。 |
| OrderedList | 克劳迪奥·Lottaz | 相似基因的有序列表 |
| OutlierD | Sukwoo金 | 异常值检测利用分位数回归在—高通量数据的散点图 |
| pamr | Rob Tibshirani | 帕姆:预测分析微阵列 |
| pcaMethods | Wolfram Stacklies | PCA方法的集合。 |
| pcot2 | 莎拉的歌 | 主坐标和霍特林的丁字尺方法 |
| pdmclass | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 微阵列分类样本使用惩罚判别方法 |
| pickgene | 布莱恩·扬德尔 | 适应性基因芯片表达数据分析 |
| plgem | 马狄亚 | 幂律全局误差模型 |
| 彪马 | 理查德·皮尔森 | 传播微阵列分析的不确定性 |
| qvalue | 约翰·d·层 | 错误发现率控制核反应能量估计 |
| RankProd | Fangxin香港 | 产品排名的方法识别差异表达基因在荟萃分析中的应用 |
| rbsurv | Sukwoo金 | 强大的基于可能性生存与微阵列数据建模 |
| rflowcyt | n LeMeur | 流式细胞术分析统计工具和数据结构 |
| rHVDM | 马蒂诺Barenco | 隐藏变量的动态建模 |
| 中华民国 | 文斯凯里 | 中华民国的公用事业,uarray焦点 |
| 安全 | 威廉·t·巴里 | 意义的分析功能和表达 |
| SAGx | 每Broberg | GeneChip的统计分析 |
| seqLogo | 奥利弗Bembom | DNA序列比对的序列标识 |
| siggenes | Holger Schwender | 多个测试使用萨姆和埃夫隆的经验贝叶斯方法 |
| sigPathway | Weil赖 | 路径分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| sizepower | Weiliang邱 | 在Micorarray研究中样本容量和功率计算 |
| SLqPCR | 马蒂亚斯•科尔 | 函数在SIRS-Lab GmbH实时定量PCR分析数据 |
| sscore | 理查德•肯尼迪 | S-Score算法Affymetrix寡核苷酸微阵列 |
| ssize | 格雷戈里·r·警告 | 估计Microarry样本大小 |
| timecourse | 玉川泰 | 统计分析发育微阵列时间进程的数据 |
| topGO | Adrian Alexa | topGO:浓缩分析基因本体 |
| 《暮光之城》 | 斯蒂芬妮Scheid | 估计当地的错误发现率 |
| VanillaICE | 罗伯特Scharpf | 方法拟合SNP芯片数据的隐马尔可夫模型 |
| vbmp | 尼古拉喇嘛 | 变分贝叶斯多项概率单位回归 |
| webbioc | 科林·a·史密斯 | Bioconductor Web界面 |