包 |
维护人员 |
标题 |
ABarray |
永明安德鲁太阳 |
应用生物系统公司(Applied Biosystems)基因组调查(Genome Survey)的微阵列(Microarray)基因表达数据的QA和统计数据分析。 |
affy |
拉斐尔·a·伊 |
Affymetrix寡核苷酸阵列的方法 |
affycomp |
拉斐尔·a·伊 |
Affymetrix表达式度量评估的图形工具箱 |
affycoretools |
詹姆斯·w·麦克唐纳 |
对于那些使用Affymetrix基因芯片做重复分析的人有用的函数。 |
AffyExpress |
Xuejun阿瑟·李 |
Affymetrix质量评估和分析工具 |
affylmGUI |
基斯Satterley |
使用limma软件包进行affy分析的GUI |
affypdnn |
Laurent Gautier |
affy包的探针依赖近邻(PDNN) |
affyPLM |
本Bolstad |
探针级模型拟合方法 |
altcdfenvs |
Laurent Gautier |
替代cdfenvs |
aroma.light |
亨利克·本特松 |
仅使用基本R数据类型的微阵列数据归一化和可视化的轻量级方法 |
arrayMagic |
Andreas Buness |
双色cDNA阵列质量控制与预处理 |
beadarray |
马克·邓宁 |
BeadArrays的质量控制和低水平分析 |
beadarraySNP |
1月东 |
Illumina SNP珠阵的正规化和报告 |
BeadExplorer |
加雷斯·维奇 |
Illumina BeadChip数据的质量控制、规范化、注释和探索 |
CALIB |
回族赵 |
从微阵列数据中估计绝对表达水平的校准模型 |
cellHTS |
Ligia胸罩 |
基于细胞的屏幕分析 |
cellHTS2 |
Ligia胸罩 |
基于细胞的屏幕分析-细胞hts的修订版 |
CGHcall |
会发生Vosse |
调用阵列CGH肿瘤谱的畸变。 |
codelink |
迭戈Diez |
Codelink生物阵列数据的操纵。 |
exonmap |
Crispin米勒 |
Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
gcrma |
z吴 |
使用序列信息的背景调整 |
genArise |
国际金融公司的开发团队 |
微阵列分析工具 |
limma |
戈登•史密斯 |
微阵列数据的线性模型 |
limmaGUI |
基斯Satterley |
GUI的limma软件包 |
LMGene |
约翰·蒂 |
基因表达阵列数据转换及差异表达基因鉴定的LMGene软件 |
光民 |
杜潘 |
Illumina微阵列的BeadArray特定方法 |
maCorrPlot |
亚历山大plone ( |
可视化微阵列数据中的人工相关性 |
maigesPack |
古斯塔沃·h·斯特维斯 |
处理cDNA微阵列数据的功能,包括数据分析的几种方法 |
makecdfenv |
詹姆斯·w·麦克唐纳 |
提供环境制造商 |
makePlatformDesign |
Benilton卡瓦略 |
平台设计方案 |
庄园 |
皮埃尔Neuvial |
全息微阵列正常化 |
marray |
杨宜华(珍) |
双色斑点微阵列数据的探索性分析 |
nnNorm |
Adi Laurentiu Tarca |
基于稳健神经网络的cDNA微阵列数据空间和强度归一化 |
益生元 |
Benilton卡瓦略 |
寡核苷酸阵列 |
奥林 |
马提亚Futschik |
双色微阵列的优化局部强度相关归一化 |
OLINgui |
马提亚Futschik |
OLIN的图形用户界面 |
oneChannelGUI |
拉斐尔一Calogero |
这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。 |
彪马 |
理查德·皮尔森 |
微阵列分析中的传播不确定性 |
罗摩 |
拉斐尔Gottardo |
微阵列的稳健分析 |
RefPlus |
Kai-Ming常 |
外推策略(RMA+)和外推平均(RMA++)方法的函数集。 |
林格 |
j . Toedling |
NimbleGen寡核苷酸阵列的研究 |
SAGx |
每Broberg |
基因芯片的统计分析 |
simpleaffy |
Crispin米勒 |
非常简单的Affymetrix数据高级分析 |
snapCGH |
约翰Marioni |
aCGH数据的分割、归一化和处理。 |
spotSegmentation |
克里斯Fraley |
微阵列点块的分割和网格化 |
stepNorm |
肖渊源 |
cDNA微阵列的逐步归一化功能 |
tilingArray |
w·休伯 |
高密度寡核苷酸贴片阵列分析 |
vsn |
沃尔夫冈•休伯 |
微阵列数据的方差稳定和校正 |