| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| ABarray | 永明安德鲁太阳 | 应用生物系统公司(Applied Biosystems)基因组调查(Genome Survey)的微阵列(Microarray)基因表达数据的QA和统计数据分析。 |
| affy | 拉斐尔·a·伊 | Affymetrix寡核苷酸阵列的方法 |
| affycomp | 拉斐尔·a·伊 | Affymetrix表达式度量评估的图形工具箱 |
| affycoretools | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 对于那些使用Affymetrix基因芯片做重复分析的人有用的函数。 |
| AffyExpress | Xuejun阿瑟·李 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma软件包进行affy分析的GUI |
| affypdnn | Laurent Gautier | affy包的探针依赖近邻(PDNN) |
| affyPLM | 本Bolstad | 探针级模型拟合方法 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代cdfenvs |
| aroma.light | 亨利克·本特松 | 仅使用基本R数据类型的微阵列数据归一化和可视化的轻量级方法 |
| arrayMagic | Andreas Buness | 双色cDNA阵列质量控制与预处理 |
| beadarray | 马克·邓宁 | BeadArrays的质量控制和低水平分析 |
| beadarraySNP | 1月东 | Illumina SNP珠阵的正规化和报告 |
| BeadExplorer | 加雷斯·维奇 | Illumina BeadChip数据的质量控制、规范化、注释和探索 |
| CALIB | 回族赵 | 从微阵列数据中估计绝对表达水平的校准模型 |
| cellHTS | Ligia胸罩 | 基于细胞的屏幕分析 |
| cellHTS2 | Ligia胸罩 | 基于细胞的屏幕分析-细胞hts的修订版 |
| CGHcall | 会发生Vosse | 调用阵列CGH肿瘤谱的畸变。 |
| codelink | 迭戈Diez | Codelink生物阵列数据的操纵。 |
| exonmap | Crispin米勒 | Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
| gcrma | z吴 | 使用序列信息的背景调整 |
| genArise | 国际金融公司的开发团队 | 微阵列分析工具 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | GUI的limma软件包 |
| LMGene | 约翰·蒂 | 基因表达阵列数据转换及差异表达基因鉴定的LMGene软件 |
| 光民 | 杜潘 | Illumina微阵列的BeadArray特定方法 |
| maCorrPlot | 亚历山大plone ( | 可视化微阵列数据中的人工相关性 |
| maigesPack | 古斯塔沃·h·斯特维斯 | 处理cDNA微阵列数据的功能，包括数据分析的几种方法 |
| makecdfenv | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 提供环境制造商 |
| makePlatformDesign | Benilton卡瓦略 | 平台设计方案 |
| 庄园 | 皮埃尔Neuvial | 全息微阵列正常化 |
| marray | 杨宜华(珍) | 双色斑点微阵列数据的探索性分析 |
| nnNorm | Adi Laurentiu Tarca | 基于稳健神经网络的cDNA微阵列数据空间和强度归一化 |
| 益生元 | Benilton卡瓦略 | 寡核苷酸阵列 |
| 奥林 | 马提亚Futschik | 双色微阵列的优化局部强度相关归一化 |
| OLINgui | 马提亚Futschik | OLIN的图形用户界面 |
| oneChannelGUI | 拉斐尔一Calogero | 这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。 |
| 彪马 | 理查德·皮尔森 | 微阵列分析中的传播不确定性 |
| 罗摩 | 拉斐尔Gottardo | 微阵列的稳健分析 |
| RefPlus | Kai-Ming常 | 外推策略(RMA+)和外推平均(RMA++)方法的函数集。 |
| 林格 | j . Toedling | NimbleGen寡核苷酸阵列的研究 |
| SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据高级分析 |
| snapCGH | 约翰Marioni | aCGH数据的分割、归一化和处理。 |
| spotSegmentation | 克里斯Fraley | 微阵列点块的分割和网格化 |
| stepNorm | 肖渊源 | cDNA微阵列的逐步归一化功能 |
| tilingArray | w·休伯 | 高密度寡核苷酸贴片阵列分析 |
| vsn | 沃尔夫冈•休伯 | 微阵列数据的方差稳定和校正 |