| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| ABarray | 永明安德鲁太阳 | 应用生物系统基因组调查微阵列(AB1700)基因表达数据的QA和统计数据分析 |
| affy | 拉斐尔·a·伊 | Affymetrix寡核苷酸阵列的方法 |
| affycomp | 拉斐尔·a·伊 | 用于Affymetrix表达度量评估的图形工具箱 |
| affycoretools | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 功能有用的那些做重复分析Affymetrix基因芯片。 |
| AffyExpress | Xuejun阿瑟·李 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
| affypdnn | Laurent Gautier | 针对affy包的依赖最近邻居探测(PDNN) |
| affyPLM | 本Bolstad | 拟合探针级模型的方法 |
| affyQCReport | 克雷格Parman | 为affyBatch对象生成QC报告 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代cdfenvs |
| annaffy | 科林·a·史密斯 | Affymetrix生物元数据注释工具 |
| aroma.light | 亨利克·本特松 | 用于只使用基本R数据类型的微阵列数据规范化和可视化的轻量级方法 |
| beadarray | 马克·邓宁 | 珠阵列的质量控制和低水平分析 |
| BeadExplorer | 加雷斯·维奇 | Illumina串珠芯片数据的QC、标准化、注释和探索 |
| 桥 | 拉斐尔Gottardo | 差异基因表达的贝叶斯鲁棒推理 |
| codelink | 迭戈Diez | 操纵Codelink生物阵列数据。 |
| 国王杯 | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 功能，以执行癌症异常值分析。 |
| exonmap | Crispin米勒 | Affymetrix外显子阵列数据的高级分析 |
| gcrma | z吴 | 利用序列信息进行背景调整 |
| GEOquery | 肖恩·戴维斯 | 从NCBI基因表达Omnibus (GEO)获取数据 |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算组间差异基因表达的全局测试 |
| globaltest | Jelle Goeman | 检测基因组与临床变量的关系 |
| lapmix | Yann Ruffieux | 微阵列实验中的拉普拉斯混合模型 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| 光民 | 杜潘 | 用于Illumina微阵列的BeadArray特异性方法 |
| 时间的 | 约翰内斯Rainer | 微阵列数据库和实用功能的微阵列数据分析。 |
| makecdfenv | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 提供环境制造商 |
| makePlatformDesign | Benilton卡瓦略 | 平台设计方案 |
| 益生元 | Benilton卡瓦略 | 寡核苷酸阵列 |
| oneChannelGUI | 拉斐尔一Calogero | 这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。 |
| 彪马 | 理查德·皮尔森 | 微阵列分析中的传播不确定度 |
| RefPlus | Kai-Ming常 | 外推策略(RMA+)和外推平均(RMA++)方法的函数集。 |
| RLMM | Nusrat Rabbee | Affymetrix SNP阵列的基因型调用算法 |
| SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| tilingArray | w·休伯 | 高密度寡核苷酸瓷砖阵列的分析 |
| vsn | 沃尔夫冈•休伯 | 微阵列数据的方差稳定和校准 |
| webbioc | 科林·a·史密斯 | Bioconductor Web界面 |