| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| affycoretools | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 对使用Affymetrix基因芯片进行重复分析有用的函数。 |
| AffyExpress | 李学军 | Affymetrix质量评估和分析工具 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代cdfenvs |
| annaffy | 科林·a·史密斯 | Affymetrix生物元数据的注释工具 |
| AnnBuilder | j .张 | Bioconductor注释数据包构建器 |
| 注释 | Biocore Team c/o BioC用户列表 | 微阵列注释 |
| AnnotationDbi | Biocore Team c/o BioC用户列表 | 标注数据库接口 |
| annotationTools | 亚历山大·库恩 | 注释微阵列和执行跨物种基因表达分析使用平面文件数据库。 |
| biomaRt | 史蒂芬Durinck | 与BioMart数据库(例如ensemble bl, Wormbase, Gramene和Uniprot)的接口 |
| 类别 | 罗伯特先生 | 类别分析 |
| ChromoViz | Jihoon金 | 基因表达数据的多模态可视化 |
| DynDoc | Biocore Team c/o BioC用户列表 | 动态文档工具 |
| ecolitk | 劳伦特 | 大肠杆菌的元数据和工具 |
| exonmap | Crispin米勒 | Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
| 群 | 保罗·香农 | 在R和Java生物信息学程序之间广播数据 |
| 总的来说 | y d 'Aubenton-Carafa | R代表基因和序列分析 |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算组间差异基因表达的全局测试 |
| globaltest | Jelle Goeman | 检测具有临床变量的基因组的关联 |
| GOstats | 罗伯特先生 | 用于操作GO和微阵列的工具。 |
| goTools | 艾格尼丝Paquet | 基因本体数据库功能 |
| KEGGSOAP | 罗伯特先生 | 客户端SOAP访问KEGG |
| matchprobes | Biocore Team c/o BioC用户列表 | 阵列上探针序列匹配的工具 |
| nem | Florian Markowetz | 嵌套效应模型来重建表型层次结构 |
| pdInfoBuilder | 文斯凯里 | 平台设计信息包构建器 |
| Resourcerer | Jianhua张 | 从TIGR Resourcerer读取注释数据或将注释数据转换为Bioconductor数据包。 |
| rmap | VJ凯里 | mapper.chip.org的接口 |
| RSNPper | VJ凯里 | 到chip.org::SNPper的接口，以获取snp相关数据 |
| SemSim | 湘郭 | 基于基因本体的语义相似性度量 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |