limma

微阵列数据的线性模型

数据分析,微阵列数据的线性模型和微分表达式。

作者 杰里米•戈登·史密斯与马修·里奇贡献银,詹姆斯•Wettenhall娜塔莉·索恩,Mette Langaas,埃吉尔Ferkingstad,弗朗索瓦·马库斯戴维Pepin和Dongseok崔。
维护人员 戈登•史密斯

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“limma”)

小插曲(文档)

包下载
limma.pdf
usersguide.pdf
源 limma_2.10.5.tar.gz
Windows二进制 limma_2.10.5.zip
OS X的二进制 limma_2.10.5.tgz

细节

biocViews
微阵列,OneChannel,TwoChannel,DataImport,质量控制,预处理,统计数据,DifferentialExpression,MultipleComparisons,TimeCourse
取决于 R,方法
建议 affy marray,质量,样条函数、sma statmod vsn
进口
SystemRequirements
许可证 LGPL
URL http://bioinf.wehi.edu.au/limma
dependsOnMe CALIB RMAGEML, Ringo affycoretools、affylmGUI arrayMagic, arrayQuality, beadarray, codelink,转换,limmaGUI,时间,marray,彪马snapCGH vsn
suggestsMe ABarray GEOquery,奥林,beadarraySNP maSigPro