fbat

基因数据的基于家族的关联测试。

该软件包实现了广泛的基于家族的遗传数据关联测试，使用来自“FBAT”软件程序的代码调整人口混合(见http://www.biostat.harvard.edu/~fbat/fbat.htm)。特征包括:-使用来自核心家庭、兄弟姐妹、血统或任何组合的数据;提供无偏倚的测试，有或没有创始人基因型。-分析二分，测量，或时间到发病特征和多个特征;Trait定义可以优化。-使用标准遗传模型(加性、显性、隐性或基因型)提供双等位基因和多等位基因关联测试。-提供零假设的大样本和蒙特卡罗精确检验:无关联和无关联;提供H0的大样本检验:无相关性。-估计等位基因频率;检验孟德尔一致性。 - Tests multiple markers using haplotypes; estimates haplotype frequencies and linkage disequilibrium between pairs of markers. - Offers two multi-marker tests for testing multiple markers simultaneously, without resolving phase or assuming no recombination. - Uses standard pedigree data files; phenotype file is optional. - Offers the Sibs Disequilibrium Test.

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“fbat”)

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