Harshlight

微阵列芯片的“纠正化妆”计划

包是用来检测扩展、扩散和紧凑的微阵列芯片上的瑕疵。Harshlight自动标志着地区一批芯片(affybatch对象)和纠正affybatch对象返回。有缺陷的区域替换与NAs或中位数的值相同的集合中的其他芯片探针。

作者 Mayte Suarez-Farinas Maurizio Pellegrino,克努特w . Mittkowsky马塞洛·o·马尼亚斯科领导。
维护人员 莫里吉奥Pellegrino

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Harshlight”)

小插曲(文档)

包下载
Harshlight.pdf
源 Harshlight_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 Harshlight_1.4.0.zip
OS X的二进制 Harshlight_1.4.0.tgz

细节

biocViews
微阵列,质量控制,预处理
取决于 R, affy
建议
进口
SystemRequirements
许可证 GPL版本2或更高版本
URL http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/
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