| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| ACME | 肖恩·戴维斯 | 计算微阵列富集(ACME)算法 |
| adSplit | 克劳迪奥·Lottaz | 注解驱动的集群 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
| BeadExplorer | 加雷斯·维奇 | Illumina BeadChip数据的QC、标准化、注释和探索 |
| Biobase | Biocore团队 | Biobase: Bioconductor的基函数 |
| bioDist | Biocore团队 | 不同的距离测量 |
| 类别 | 美国猎鹰 | 类别分析 |
| CoCiteStats | r .绅士 | 基于共引的不同测试统计。 |
| CORREP | Dongxiao朱 | 多元相关估计和统计推断程序。 |
| daMA | Jobst Landgrebe | 阶乘双色微阵列数据的高效设计与分析 |
| DEDS | 肖渊源 | 微阵列数据的距离汇总差分表达式 |
| diffGeneAnalysis | Choudary Jagarlamudi | 执行差异基因表达分析 |
| EBarrays | Deepayan Sarkar | 微阵列的经验贝叶斯 |
| edd | 文斯凯里 | 表达密度诊断 |
| exonmap | 米甲Okoniewski | Affymetrix外显子阵列数据的高水平分析 |
| factDesign | 丹尼斯Scholtens | 析因设计微阵列实验分析 |
| genefilter | Biocore团队 | 基因过滤器:从微阵列实验中过滤基因的方法 |
| GeneMeta | Biocore团队 | 高通量实验的元分析 |
| GGtools | 文斯凯里 | 基因基因组学软件和数据(c) 2006 VJ Carey |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算组间差异基因表达的全局测试 |
| globaltest | Jelle Goeman | 检测具有临床变量的基因组的关联 |
| GOstats | 美国猎鹰 | 用于操作GO和微阵列的工具。 |
| gpl | Biocore团队 | 广义偏最小二乘分类 |
| GraphAT | 托马斯LaFramboise | 图论关联测验 |
| 哼哼 | HyungJun曹 | 多条件下差异表达基因鉴别的异构误差模型 |
| Icens | Biocore团队 | 删减和截断数据的NPMLE |
| 嫁祸于 | Balasubramanian纳史木汗 | impute:微阵列数据的impute |
| lapmix | Yann Ruffieux | 微阵列实验中的拉普拉斯混合模型 |
| LBE | 西里尔Dalmasso | 错误发现率的估计。 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | 用于limma包的GUI |
| LMGene | 约翰·蒂 | 用于基因表达阵列中差异表达基因的数据转换和鉴定的LMGene软件 |
| 简述 | Nitin耆那教徒的 | 微阵列数据的局部合并误差分析方法 |
| made4 | Aedin Culhane | 利用ADE4对微阵列数据进行多元分析 |
| MantelCorr | 布莱恩Steinmeyer | 计算壁炉架集群相关性 |
| MeasurementError.cor | 坞城叮 | 相关系数的测量误差模型估计 |
| metaArray | 遭受崔 | 集成微阵列数据进行元分析 |
| MLInterfaces | 诉凯利 | 生物导体容器中数据的R机器学习过程的统一接口 |
| nem | Florian Markowetz | 嵌套效应模型来重建表型层次结构 |
| OCplus | 亚历山大plone ( | 微阵列实验的操作特性、样本量和局部fdr |
| oneChannelGUI | Raffaele A Calogero | 这个包扩展了affylmGUI图形界面的功能。 |
| pcaMethods | Wolfram Stacklies | PCA方法的集合。 |
| 彪马 | 理查德·皮尔森 | 微阵列分析中的传播不确定性 |
| rbsurv | Sukwoo金 | 基于微阵列数据的稳健可能性生存建模 |
| rflowcyt | n LeMeur | 流式细胞分析的统计工具和数据结构 |
| 中华民国 | 文斯凯里 | ROC的实用程序，以uarray为焦点 |
| SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
| sigPathway | Weil赖 | 路径分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| sizepower | Weiliang邱 | 微阵列研究中的样本容量和功率计算 |
| SLqPCR | 马蒂亚斯•科尔 | SIRS-Lab GmbH的实时定量PCR数据分析功能 |
| sscore | 理查德•肯尼迪 | Affymetrix寡核苷酸微阵列的S-Score算法 |
| ssize | 格雷戈里·r·沃恩斯 | 估计微阵列样本量 |
| topGO | Adrian Alexa | topGO:基因本体的富集分析 |
| 《暮光之城》 | 斯蒂芬妮Scheid | 估计局部错误发现率 |