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affycoretools 詹姆斯·w·麦克唐纳 函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips。
annaffy 科林·a·史密斯 Affymetrix生物元数据注释工具
DynDoc Biocore团队 动态文档工具
exonmap 米甲Okoniewski 高水平的分析Affymetrix外显子数组的数据
simpleaffy Crispin米勒 非常简单的Affymetrix数据的高级分析