用微阵列数据测试差异表达的基因。该包装可以与cDNA微阵列或Affymetrix芯片一起使用。包装适合强大的贝叶斯分层模型,用于测试差异表达。使用$ t $分布方式对离群值进行显式建模。该模型包括可交换的差异的先验,该方差允许基因的不同方差,但仍会收缩极端的经验方差。我们的模型可用于在多个样品中测试差异表达的基因,并可以区分有三个或多个样品时差异表达的不同模式。参数估计是使用新颖的马尔可夫链蒙特卡洛进行的,当模型将质量放在完整参数空间的子空间上时,这是合适的。
作者 | 拉斐尔·戈塔多(Raphael Gottardo) |
维护者 | 拉斐尔·戈塔多(Raphael Gottardo) |
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