| 包裹 | 维护者 | 标题 |
|---|---|---|
| Abarray | Yongming Andrew Sun | 用于应用生物系统基因组测量阵列（AB1700）基因表达数据的微阵列QA和统计数据分析。 |
| 副词 | Rafael A. Irizarry | Affymetrix寡核苷酸阵列的方法 |
| AffyComp | Rafael A. Irizarry | 用于评估Affymetrix表达度量的图形工具箱 |
| Affycoretools | 詹姆斯·W·麦克唐纳 | 对使用Affymetrix Genechips进行重复分析的人有用的功能。 |
| affylmgui | 基思·萨特利 | 使用Limma软件包进行AFFY分析的GUI |
| affypdnn | 劳伦特 | 探测依赖的最近邻居（PDNN） |
| affyplm | 本·布尔斯塔德 | 拟合探针级模型的方法 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代CDFENV |
| applera | Francesca Cordero | applera |
| 香气 | Henrik Bengtsson | 仅使用基本R数据类型的微阵列数据标准化和可视化的轻量级方法 |
| arraymagic | Andreas Buness | 两色cDNA阵列质量控制和预处理 |
| Beadarray | 马克·邓宁 | 质量控制和低水平分析珠阵列 |
| Beadarraysnp | Jan Oosting | Illumina SNP珠阵列的标准化和报告 |
| Beadexplorer | Gareth Elvidge | QC，标准化，注释和探索Illumina Beadchip数据 |
| Cellhts | Ligia Bras | 分析基于细胞的屏幕 |
| codelink | 迭戈·迪兹（Diego Diez） | 操纵Codelink生物阵列数据。 |
| GCRMA | Z. Wu | 使用序列信息进行背景调整 |
| genarise | IFC开发团队 | 微阵列分析工具 |
| 刺激性 | 毛里齐奥·佩莱格里诺（Maurizio Pellegrino） | 微阵列芯片的“矫正化妆”程序 |
| 林玛 | 戈登·史密斯（Gordon Smyth） | 微阵列数据的线性模型 |
| 利马瓜 | 基思·萨特利 | limma套餐的GUI |
| lmgene | Geun Cheol Lee | LMGENE软件用于日期转化和鉴定基因表达阵列中差异表达的基因 |
| macorrplot | 亚历山大·普洛纳（Alexander Ploner） | 可视化微阵列数据中的人工相关性 |
| makecdfenv | 詹姆斯·W·麦克唐纳 | CDF环境制造商 |
| 庄园 | 皮埃尔·诺维亚尔（Pierre Neuvial） | CGH微阵列归一化 |
| Marray | Yee Hwa（Jean）Yang | 两色斑点微阵列数据的探索性分析 |
| mmgmos | Xuejun Liu | 寡核苷酸信号的多芯片修饰伽马模型 |
| nnnorm | Tarca Laurentiu | 基于稳健的神经网的cDNA微阵列数据基于空间和强度的归一化 |
| 奥林 | Matthias Futschik | 两色微阵列的优化局部强度依赖性归一化 |
| Olingui | Matthias Futschik | OLIN的图形用户界面 |
| 拉玛 | 拉斐尔·戈塔多（Raphael Gottardo） | 微阵列的强大分析 |
| sagx | 每个布尔伯格 | 统计分析 |
| 简单 | 克里斯平·米勒（Crispin Miller） | 非常简单的Affymetrix数据的高水平分析 |
| Snapcgh | 迈克·史密斯 | ACGH数据的分割，归一化和处理。 |
| 细分 | 克里斯·弗雷利（Chris Fraley） | 微阵列分割和微阵列块的网格 |
| Stepnorm | Yuanyuan Xiao | cDNA微阵列的逐步归一化函数 |
| 蒂格拉里 | W. Huber | 分析高密度寡核苷酸瓷砖阵列 |
| VSN | 沃尔夫冈·胡伯 | 微阵列数据的方差稳定和校准 |