| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| aCGH | 简Fridlyand | 阵列比较基因组杂交数据的类和函数。 |
| adSplit | 克劳迪奥·Lottaz | 注解驱动的集群 |
| affxparser | 布拉德 | Affymetrix SDK文件解析 |
| affy | 拉斐尔·a·伊 | 方法Affymetrix寡核苷酸阵列 |
| affycomp | 拉斐尔·a·伊 | 图形工具箱Affymetrix表达的评估措施 |
| affycoretools | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips。 |
| affydata | 劳伦特 | Affymetrix数据出于演示目的 |
| affyio | 本杰明·米洛Bolstad | 解析Affymetrix数据文件的工具 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | GUI使用limma affy分析包 |
| affypdnn | 劳伦特 | 最近的邻居(PDNN)调查依赖affy包 |
| affyPLM | 本Bolstad | 方法拟合probe-level模型 |
| affyQCReport | 克雷格Parman | 为affyBatch对象QC报告生成 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代cdfenvs |
| annaffy | 科林·a·史密斯 | Affymetrix生物元数据注释工具 |
| AnnBuilder | j .张 | Bioconductor注释数据包生成器 |
| 注释 | Biocore团队 | 注释的微阵列 |
| apComplex | 丹尼斯Scholtens | 估计蛋白质复杂的会员使用AP-MS数据 |
| applera | 弗朗西斯卡Cordero | applera |
| arrayMagic | Andreas Buness | 双色cDNA数组质量控制和预处理 |
| arrayQuality | 答:Paquet | 数组质量评估发现数组 |
| beadarray | 马克·邓宁 | 质量控制和低级BeadArrays分析 |
| 荡妇 | 布莱恩·扬德尔 | 贝叶斯区间映射诊断 |
| Biobase | Biocore团队 | Bioconductor Biobase:基函数 |
| biocViews | 赛斯猎鹰 | 分类视图的R包存储库 |
| bioDist | Biocore团队 | 不同距离的措施 |
| biomaRt | 史蒂芬Durinck | 接口BioMart数据库(例如运用) |
| Biostrings | h .页面 | 字符串对象代表生物序列,和匹配算法 |
| 桥 | 拉斐尔Gottardo | 贝叶斯强劲的推理微分基因表达 |
| 类别 | r .绅士 | 类别分析 |
| cellHTS | 沃尔夫冈•休伯 | 分析基于单元的屏幕 |
| cghMCR | j .张 | 发现染色体区域显示共同收益/损失 |
| ChromoViz | Jihoon金 | 多通道基因表达数据的可视化 |
| clusterStab | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 计算集群稳定微阵列数据的分数 |
| CoCiteStats | r .绅士 | 基于co-citation不同的测试数据。 |
| codelink | 迭戈D�ez | 操纵Codelink Bioarrays数据。 |
| 转换 | 绮华(Jean) | 微阵列数据转换对象 |
| 国王杯 | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 函数来执行癌症离群值剖面分析。 |
| ctc | 安东尼·卢卡斯 | 集群和树转换。 |
| daMA | Jobst Landgrebe | 高效的阶乘双色设计和分析微阵列数据 |
| DEDS | 肖渊源 | 微分表达式通过距离微阵列数据的总结 |
| diffGeneAnalysis | Choudary Jagarlamudi | 执行差异基因表达分析 |
| DNAcopy | e . s .万卡特拉曼·莱马克里斯 | DNA拷贝数的数据分析 |
| DynDoc | Biocore团队 | 动态文档工具 |
| EBarrays | Deepayan Sarkar | 经验贝叶斯微阵列 |
| EBImage | 奥列格Sklyar | EBImage: R图像处理工具箱 |
| ecolitk | 劳伦特 | 元数据和工具为大肠杆菌 |
| edd | 文斯凯里 | 表达密度诊断 |
| exprExternal | Biocore团队 | 使用externalVectors exprSet的实现 |
| externalVector | Biocore团队 | 向量R与外部存储对象 |
| factDesign | 丹尼斯Scholtens | 的阶乘设计微阵列实验分析 |
| fdrame | 有效率切尼克斯贝格 | 罗斯福调整微阵列实验(FDR-AME) |
| gcrma | z吴 | 背景调整使用序列信息 |
| genArise | 国际金融公司的开发团队 | 微阵列分析工具 |
| genefilter | Biocore团队 | genefilter:筛选基因 |
| GeneMeta | Biocore团队 | MetaAnalysis为高通量实验 |
| geneplotter | Biocore团队 | Grapics Bioconductor相关功能 |
| 总的来说 | y d 'Aubenton-Carafa | R基因和序列分析 |
| geneRecommender | 格雷格已经 | 一个基因推荐算法来识别基因coexpressed与查询的一组基因 |
| GeneSpring | 索恩de Boer | GeneSpring R集成功能 |
| GeneTraffic | 丹尼尔Iordan | GeneTraffic R集成功能 |
| 麝猫 | Korbinian Strimmer | 微阵列时间序列和网络分析 |
| GenomeBase | h .页面 | 基本功能基因组数据方案操作 |
| GEOquery | 肖恩·戴维斯 | 从NCBI基因表达综合(GEO)获得数据 |
| gff3Plotter | 奥列格Sklyar | 绘制基因组布局上的实验数据 |
| 很高兴 | 菲利普·玫瑰� | DNA的得失分析 |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算全球测试组间差异基因表达 |
| globaltest | Jelle Goeman | 测试协会组织的基因与临床变量 |
| goCluster | 贡纳Wrobel | 聚类分析结果与注释数据。 |
| GOstats | r .绅士 | 去微阵列的操作工具。 |
| goTools | 艾格尼丝Paquet | 功能基因本体数据库 |
| gpl | Biocore团队 | 使用广义偏最小二乘回归分类 |
| 图 | 赛斯猎鹰 | 图:一个包来处理图形数据结构 |
| GraphAT | 托马斯LaFramboise | 图理论协会测试 |
| Heatplus | 亚历山大plone ( | 一个热图显示协变量和着色集群 |
| 哼哼 | HyungJun曹 | 非均匀误差模型在多种条件下的差异表达基因的识别 |
| hexbin | 尼古拉斯Lewin-Koh | 六角面元的例程 |
| hopach | 凯瑟琳·s·波拉德 | 分层要求分区和混合(HOPACH)崩溃 |
| 超图 | 赛斯猎鹰 | 一个包提供超图数据结构 |
| Icens | Biocore团队 | NPMLE审查和截断数据 |
| 染色体组型 | 卡尔·j·Dykema | 染色体组型 |
| 嫁祸于 | Balasubramanian纳史木汗 | 转嫁:微阵列数据的归责 |
| iSPlot | 伊丽莎白·惠伦 | 连接图 |
| KEGGSOAP | j .张 | 客户端SOAP访问KEGG |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | GUI对limma包 |
| LMGene | Geun Cheol李 | LMGene日期转换软件和识别差异表达基因的基因表达的数组 |
| logicFS | Holger Schwender | 识别SNP的交互 |
| 简述 | Nitin耆那教徒的 | 方法分析微阵列数据使用本地集中错误(简述)方法 |
| maanova | Lei吴 | 分析微阵列实验的工具 |
| macat | Joern Toedling | 微阵列染色体分析工具 |
| maCorrPlot | 亚历山大plone ( | 在微阵列数据可视化人工相关性 |
| 时间的 | 约翰内斯Rainer | 芯片微阵列数据分析的数据库和效用函数。 |
| made4 | Aedin Culhane | 使用ADE4微阵列数据的多变量分析 |
| makecdfenv | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 提供环境制造商 |
| 庄园 | 皮埃尔Neuvial | 微阵列正常化 |
| MantelCorr | 布莱恩Steinmeyer | 曼特尔计算集群的相关性 |
| marray | 绮华(Jean) | 探索性分析可以发现微阵列数据 |