| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| affy | 拉斐尔·a·伊 | 方法Affymetrix寡核苷酸阵列 |
| affycomp | 拉斐尔·a·伊 | 图形工具箱Affymetrix表达的评估措施 |
| affycoretools | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips。 |
| affydata | 劳伦特 | Affymetrix数据出于演示目的 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | GUI使用limma affy分析包 |
| affypdnn | 劳伦特 | 最近的邻居(PDNN)调查依赖affy包 |
| affyPLM | 本Bolstad | 方法拟合probe-level模型 |
| affyQCReport | 克雷格Parman | 为affyBatch对象QC报告生成 |
| altcdfenvs | Laurent Gautier | 替代cdfenvs |
| annaffy | 科林·a·史密斯 | Affymetrix生物元数据注释工具 |
| applera | 弗朗西斯卡Cordero | applera |
| beadarray | 马克·邓宁 | 质量控制和低级BeadArrays分析 |
| 桥 | 拉斐尔Gottardo | 贝叶斯强劲的推理微分基因表达 |
| codelink | 迭戈D�ez | 操纵Codelink Bioarrays数据。 |
| 国王杯 | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 函数来执行癌症离群值剖面分析。 |
| gcrma | z吴 | 背景调整使用序列信息 |
| GEOquery | 肖恩·戴维斯 | 从NCBI基因表达综合(GEO)获得数据 |
| gff3Plotter | 奥列格Sklyar | 绘制基因组布局上的实验数据 |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算全球测试组间差异基因表达 |
| globaltest | Jelle Goeman | 测试协会组织的基因与临床变量 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| 时间的 | 约翰内斯Rainer | 芯片微阵列数据分析的数据库和效用函数。 |
| makecdfenv | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 提供环境制造商 |
| mmgmos | Xuejun刘 | multi-chip修改γ的寡核苷酸信号模式 |
| panp | 华伦 | 从负链匹配Probesets Presence-Absence调用 |
| 钳子 | Crispin米勒 | 算法实现了Affymetrix钳子 |
| RLMM | Nusrat Rabbee | 一个基因型算法呼吁Affymetrix SNP数组 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| tilingArray | w·休伯 | 分析高密度寡核苷酸花砖数组 |
| vsn | 沃尔夫冈•休伯 | 微阵列数据的方差稳定化和校准 |
| webbioc | 科林·a·史密斯 | Bioconductor Web界面 |