包 |
维护人员 |
标题 |
affycoretools |
詹姆斯·w·麦克唐纳 |
函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips。 |
altcdfenvs |
Laurent Gautier |
替代cdfenvs |
annaffy |
科林·a·史密斯 |
Affymetrix生物元数据注释工具 |
AnnBuilder |
j .张 |
Bioconductor注释数据包生成器 |
注释 |
Biocore团队 |
注释的微阵列 |
biomaRt |
史蒂芬Durinck |
接口BioMart数据库(例如运用) |
类别 |
r .绅士 |
类别分析 |
ChromoViz |
Jihoon金 |
多通道基因表达数据的可视化 |
DynDoc |
Biocore团队 |
动态文档工具 |
ecolitk |
劳伦特 |
元数据和工具为大肠杆菌 |
总的来说 |
y d 'Aubenton-Carafa |
R基因和序列分析 |
GlobalAncova |
r·迈斯特 |
计算全球测试组间差异基因表达 |
globaltest |
Jelle Goeman |
测试协会组织的基因与临床变量 |
goCluster |
贡纳Wrobel |
聚类分析结果与注释数据。 |
GOstats |
r .绅士 |
去微阵列的操作工具。 |
goTools |
艾格尼丝Paquet |
功能基因本体数据库 |
KEGGSOAP |
j .张 |
客户端SOAP访问KEGG |
matchprobes |
Biocore团队 |
工具的探针序列匹配的数组 |
Resourcerer |
Jianhua张 |
读取注释数据从TIGR Resourcerer或注释数据转换成pacakge Bioconductor数据。 |
rmap |
VJ凯里 |
接口到mapper.chip.org |
RSNPper |
VJ凯里 |
SNP-related数据接口chip.org: snp |
simpleaffy |
Crispin米勒 |
非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |