查询网络资源
需要仔细编写依赖于对网络资源的访问的包。Web资源可能会改变位置，可能暂时不可用，或者访问和检索的速度非常慢。查询web资源的函数应该预料到并优雅地处理这种情况——当资源在合理的时间范围内不可用时，就会迅速而清晰地失败。一些可以避免的问题出现在Bioconductor包代码包含无限循环，使用一切可用R连接和不清楚的错误消息。
指导原则
还记得Bioconductor包是跨多个操作系统每晚构建的，用户可以从易于运行的小插图和示例中获益。
下载适当大小的文件。使用
system.time ()估计下载时间。请记住，运行该包所需的时间应该少于5分钟R CMD检查——no-build-vignettes。设置函数尝试某个URL的次数限制。避免
而()没有保证终止的声明。这将成为无限循环并最终导致构建系统超时年代。提供信息性错误消息。
资源查询模板
这个函数可以作为适当的资源检索的模板。它在失败之前尝试检索资源一次或多次，并将其作为参数:
URL，通常是要查询的资源人物(1)或url ()。有趣的，用于查询资源。的例子可能包括readline (),download.file (),httr: GET (),RCurl: getURL ()。…:附加参数有趣的。N.TRIES:尝试URL的次数;只有在特殊情况下，这个值才可能与默认值不同。
返回值是检索到的资源。如果资源检索失败，该函数指示失败，包括最后一次尝试的条件(错误)消息。警告以正常的方式传播给用户。
getURL <- function(URL, FUN，…),N.TRIES=1L) { N.TRIES <- as.integer(N.TRIES) stopifnot(length(N.TRIES) == 1L, !is.na(N.TRIES)) while (N.TRIES > 0L) { result <- tryCatch(FUN(URL, ...), error=identity) if (!inherits(result, "error")) break N.TRIES <- N.TRIES - 1L } if (N.TRIES == 0L) { stop("'getURL()' failed:", "\n URL: ", URL, "\n error: ", conditionMessage(result)) } result }基地R函数的使用url ()连接方面getOption(“超时”);看到url ?获取详细信息。
有趣的可能实现来检索资源并测试状态，例如，
response <- httr::GET(URL, timeout(getOption("timeout"))，…)stop_for_status(response) response}
