添加到Bioconductor项目需要biocViews:
字段的描述文件。字段名“biocViews”区分大小写,必须以小写的“b”开头。
biocViews术语是用来描述给定包的“关键字”。它们被大致分为三类,代表在《国际邮联》中出现的包裹类型Bioconductor项目- - - - - -
软件
注释数据
实验数据
biocViews可用于释放和重击的分支机构Bioconductor。devel分支在树形结构下有一个复选框,当选中该复选框时,除了正在使用的biocViews外,还会显示任何包定义但没有使用的biocViews。
人们可以将生物景观用于两个广泛的目的。
研究人员可能想要识别Bioconductor与特定目的有关的项目。例如,人们可能想要寻找所有与“拷贝数变体”相关的包。
在开发过程中,包的贡献者可以用biocViews“标记”他们的包,这样当有人寻找包时(如场景1)就可以很容易地找到他们的包。
参观重击在将biocViews添加到新包的过程中,biocViews的分支。从层次结构中识别尽可能多的术语。在层次结构的末尾更喜欢“叶子”术语,而不是更具包容性的术语。请记住选中显示所有可用条款的框。
请注意:
你的包裹将只属于一个部分Bioconductor项目(软件、注释数据或实验数据),所以从这个类别中只选择biocViews。
包中列出的biocViews必须与biocViews层次结构中的术语完全匹配(例如,拼写、大写)。
当您提交您的新包进行审查时,您的包将由Bioconductor项目。我们检查以下biocViews:
包贡献者添加了biocViews。
biocViews是有效的。
包贡献者只从其中一个类别添加了biocViews。
如果您在提交了包之后收到了关于这些biocViews的“推荐”指示,您可以按照这里给出的指示尝试自己修改它们,或者向您的包审阅者询问更多信息。