Bioconductor已转往理工学院领取供稿包;颠覆日志不再活动。以下是git的日志。

GIT日志

这是最近提交到git.bioconductor的列表，它是Bioconductor GIT存储库的主(开发)分支。

此列表也可作为RSS供应(主分支),RSS频道(发布分支)

包:ggtreeExtra
提交:8267 f5c901cd5116ef1a79f63d56b356a66e70b2
作者:香品
日期:2020-12-31 18:06:41 +0800
提交的信息:

更新新闻和碰撞版本
包:ggtreeExtra
提交:8567 b82b9ccbd7e7111396dd3397ca4e0fc29749
作者:香品
日期:2020-12-31 17:41:31 +0800
提交的信息:

支持密度脊图
包:rWikiPathways
提交:186 c6955b42ba61213497b47d318cdfd18c3e120
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-31 01:09:13 -0800
提交的信息:

只在交互会话中调用browseURL()这避免了我们在某些Windows系统(例如riesling1)上观察到的“文件关联”问题。请注意，这个问题是由Dan在https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2015-August/431411.html于2015年报告的。
包:ComplexHeatmap
提交:5168083 e2dcf621358226436e5c8a7e0ce6afc76
作者:顾祖光
日期:2020-12-31 10:04:18 +0100
提交的信息:

更新文档
包:ComplexHeatmap
提交:aa768a8fd3ae31648c0bddef44444eac8a8dbe39
作者:顾祖光
日期:2020-12-31 10:03:07 +0100
提交的信息:

版本撞
包:ComplexHeatmap
提交:9 f1ba97c3372cab0cbe60197c937fb2709da885d
作者:顾祖光
日期:2020-12-31 10:02:28 +0100
提交的信息:

添加save_last选项
包:miRBaseConverter
提交:0 bb8969bc3c071fef378c0f820e9d632683ddde8
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-31 00:57:49 -0800
提交的信息:

只在交互会话中调用browseURL()这避免了我们在某些Windows系统(例如riesling1)上观察到的“文件关联”问题。请注意，这个问题是由Dan在https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2015-August/431411.html于2015年报告的。
包:hpar
提交:d553ee260433815c8b25cbebebf8532a0cafb57b
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-31 00:35:39 -0800
提交的信息:

只在交互会话中调用browseURL()这避免了我们在某些Windows系统(例如riesling1)上观察到的“文件关联”问题。请注意，此问题由Dan在https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2015-August/431411.html于2015年报告，并已由commit 27a7df42解决。
包:MSGFgui
提交:f473795e4d8e8a5c968aeec2b66fd8f73ce7114a
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-30 22:04:24 -0800
提交的信息:

不支持32位Windows(不再支持32位Windows的JDK)
包:收回
提交:e46916b3cecd235fc316dd4996242bdecd460a29
作者:Panagiotis Moulos
日期:2020-12-31 07:52:18 +0200
提交的信息:

修复了RNA-Seq中断开绑定检查的错误(当所有入绑定时失败)
包:CoGAPS
提交:8 e52cf680a4185fd48482cbd2678d2560b3d2a23
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-30 17:47:01 -0800
提交的信息:

在Windows上不需要使用-march=native，它也可能导致问题，例如它似乎在riesling1上触发了这个mingw-w64错误:https://sourceforge.net/p/mingw-w64/mailman/message/36287627/
包:MSnbase
提交:81072 c14f8c30c3aa9f4ff6a515099e7c12bcc18
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-30 00:43:42 +0100
提交的信息:

文档:删除主动devel的提及，并在前言中添加第二次引用
包:MSnbase
提交:5 aef0f77e559ba3ba1327dc7c27983b7ffe5fb18
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-28 20:32:03 +0100
提交的信息:

更新README文件
包:MSnbase
提交:ef82a293af2eb1c12806dffad63103a64b34829a
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-28 11:37:56 +0100
提交的信息:

重构:使用msscoreutils::medianPolish()
包:MSnbase
提交:b2408e91ff739582c7ea9e6c07e91994b89dbd44
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 21:52:52 +0100
提交的信息:

修复:删除链接到外部Rds以避免警告
包:MSnbase
提交:bcd49edf52e602f2c07ca197a4eeb21fef7cc97f
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 21:40:56 +0100
提交的信息:

build:不导入preprocessCore
包:MSnbase
提交:5167 f98a98d5db41ada735b469c9e762561db5ab
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 21:36:47 +0100
提交的信息:

重构:使用msscoreutils::robustSummary()(并删除此处的代码)
包:MSnbase
提交:a5a775e497d1892ee78df10c9b244f343c17fa91
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 21:06:39 +0100
提交的信息:

测试:单元测试的impute,MSnSet
包:MSnbase
提交:4 d703f9f5ad3e0f05801c8076b592768b8167988
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 21:04:49 +0100
提交的信息:

测试:单元测试的impute,MSnSet
包:MSnbase
提交:0 e5b7adb97104da1cca84e8493f6a7ffbcca4515
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 19:57:40 +0100
提交的信息:

docs:添加rooxygen生成的formatRt手册页
包:MSnbase
提交:8 a05577304cec0e9b5f0226cd71413524fc10b64
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 19:56:55 +0100
提交的信息:

修复formatRt单元测试失败的问题
包:MSnbase
提交:ff4b07c8b5f4b1bae56548357987810739d847a2
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 19:34:51 +0100
提交的信息:

修复:不打印rt时失踪
包:MSnbase
提交:f7473f8f0a4584f4fcc1c7559aa1fd12f602b729
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 19:26:39 +0100
提交的信息:

在formatRt()中使用MsCoreUtils::formatRt()
包:MSnbase
提交:f9df595a1fbb25659df3d609fc91c0e86d612e0d
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 18:27:25 +0100
提交的信息:

refactor:使用mscoretils::normalize_matrix()进行normalize, msnset方法
包:MSnbase
提交:fe5fb3a26a0dfe8cf1938081e6dd3209184db35f
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 17:44:22 +0100
提交的信息:

不要运行BiocCheck
包:MSnbase
提交:06 b72cdbdef8f5480b2ae66f1d985a7c7955aa3d
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 17:17:18 +0100
提交的信息:

重构:删除imputation测试(移动到MsCoreUtils)
包:MSnbase
提交:89058 ada9d20ece0ba7d1607c789d7ba36febd84
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 16:55:27 +0100
提交的信息:

doc:使用TMT16和MsCoreUtils::imputeMethods，指向MsCoreUtils::impute_matrix() '
包:MSnbase
提交:835 e3ca45189dc61dc2de9e732ddfe3c2c7ac598
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 16:51:28 +0100
提交的信息:

refactor:使用MsCoreUtils::impute_matrix()进行impute, msnset方法
包:MSnbase
提交:33 e7f7b58bf8079e2b1abde9ea82f6093d08e790
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 14:50:53 +0100
提交的信息:

手动安装preprocessCore，只在biodocker devel上运行action
包:MSnbase
提交:1 b52bec436fde9606d31bada05b368a3e9229d4c
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-08 15:55:01 +0100
提交的信息:

Merge pull request #536 from lgatto/jomaster ci:手动安装magick
包:MSnbase
提交:b3dd6dcc37a18d3cabdd6fdbd58fbe2809c7bf55
作者:jorainer
日期:2020-12-08 14:54:10 +0100
提交的信息:

Ci:手动安装魔术
包:OncoSimulR
提交:6 f7ba7f8a469f5d1aedf35c5d5242247c8559d70
作者:ramon diaz-uriarte (at Phelsuma)
日期:2020-12-30 16:01:49 +0100
提交的信息:

v.2.99.7
包:DESeq2
提交:51 e08280b444a39f423452ffd1469d9c13c10788
作者:mikelove
日期:2020-12-30 09:37:03 -0500
提交的信息:

版本撞
包:DESeq2
提交:6 d11b3db21bb3b43875cfae4fee579daf00c30f8
作者:Mike Love
日期:2020-12-30 09:35:43 -0500
提交的信息:

合并pull request #32 from const-ae/update_glmGamPoi_citation更新glmGamPoi引用到生物信息学的已发表版本
包:DESeq2
提交:2 a50a814fe79e9ac225a0cef97222c6e93cfb18e
作者:const-ae
日期:2020-12-28 19:08:50 +0100
提交的信息:

更新glmGamPoi引文到生物信息学出版版
包:EnMCB
提交:b92d782a4be0c2c1d3234bc9fd6358d72fb452fc
作者:于昕MacBook pro
日期:2020-12-30 22:08:21 +0800
提交的信息:

1.3.1 12 _30_5
包:EnMCB
提交:88 f66ef70e46c78874ab7ebdf49ddb2ecea44b02
作者:于昕MacBook pro
日期:2020-12-30 21:42:20 +0800
提交的信息:

合并git.bioconductor的分支“master”:packages/EnMCB
包:EnMCB
提交:b515d4b5479e89e6f525e1871357c07b593665b0
作者:于昕MacBook pro
日期:2020-12-30 19:12:02 +0800
提交的信息:

1.3.1 12 _30_4
包:EnMCB
提交:51 e25d98bed5d9d42f086caf64121bed1a188bb2
作者:于昕MacBook pro
日期:2020-12-30 19:12:02 +0800
提交的信息:

1.3.1 12_30_3合并git.bioconductor的分支“master”:packages/EnMCB #冲突:# NAMESPACE # R/metricMCB。R # R/metricMCB_cv。R
包:EnMCB
提交:97451 b11a7eb9f1e2dc1c0da70ea9686c3186e1d
作者:于昕MacBook pro
日期:2020-12-30 15:07:02 +0800
提交的信息:

1.3.1 12 _30_2
包:EnMCB
提交:1 df0cd44226bae941b7f23ca13b579966342dfed
作者:于昕MacBook pro
日期:2020-12-30 15:07:02 +0800
提交的信息:

1.3.1 12 _30
包:dittoSeq
提交:43 dbc1e3374531e1434c542132b3c435a0d702e1
作者:dtm2451
日期:2020-12-29 16:45:50 -0800
提交的信息:

版本碰撞和新闻更新
包:dittoSeq
提交:2 d027edc8e3c2b4f06e36ffbd2c60fd72c5c9aec
作者:dtm2451
日期:2020-12-29 16:40:12 -0800
提交的信息:

扩展的。hover '输出逻辑更新到dittoPlotVarsAcrossGroups
包:dittoSeq
提交:6 a71be8a6fa1e86b16e416e722bb5887a81ba1b2
作者:dtm2451
日期:2020-12-29 16:19:53 -0800
提交的信息:

为出版物的高级访问版本添加引用
包:dittoSeq
提交:e6d9d25a73a6c0ac4ba06073d200df2c1a215d78
作者:dtm2451
日期:2020-12-29 16:19:05 -0800
提交的信息:

更新' dittoPlot() '悬停逻辑悬停逻辑更改:-忽略ridgeplots的plot转换请求(警告消息相应调整)-否则，尽管悬停。每个单元生成文本(=抖动点)，即使没有请求抖动，也始终转换为plot。
包:OncoSimulR
提交:3 c244b05ebbb5b0f8d2b895e76b5d39d1a00cf40
作者:ramon diaz-uriarte (at Phelsuma)
日期:2020-12-30 01:43:01 +0100
提交的信息:

正确的日期
包:OncoSimulR
提交:007 e09ecc55afc74eff76d49ce0451bbfaf322ca
作者:ramon diaz-uriarte (at Phelsuma)
日期:2020-12-30 01:39:06 +0100
提交的信息:

V.2.99.6:没有v.1，略快的小插曲
包:OncoSimulR
提交:f417ffed623f8d2fd5e864ca84798e6d4d2d2043
作者:ramon diaz-uriarte (at Phelsuma)
日期:2020-12-30 01:29:19 +0100
提交的信息:

V. 2.99.6: no V. 1
包:cbaf
提交:3 f3124722804c3debc528676b9f685c8bbf8dc39
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-30 01:33:40 +0330
提交的信息:

撞版
包:cbaf
提交:7 dea5c06b9497fb91935c65b45c3de5fcecdd7d6
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-30 01:19:39 +0330
提交的信息:

平衡行距和间距，增加自动边距。
包:cbaf
提交:8 afcbce4f2968fefe4a1e0729019961b1c5b2421
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-30 00:53:17 +0330
提交的信息:

修改geneLimit的默认值为50，并修复if'else系统中的一个错误。
包:cbaf
提交:23 efe052982b25bc8367d328808f163dccb1e34b
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-30 00:12:52 +0330
提交的信息:

改进了heatmapOutput的解析消息
包:cbaf
提交:86 b892244dc0f01a1e62f962fd933e13bf1a5141
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-29 15:53:19 +0330
提交的信息:

改进了heatmapOutput的解析消息
包:cbaf
提交:5418375 db69e2f11b4c8f6974a9e52c99e21c6ac
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-29 13:16:46 +0330
提交的信息:

支持PDF格式的热图
包:cbaf
提交:563087 ed1435867c41036203557bc66586810359
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-28 20:16:51 +0330
提交的信息:

修复openxlsx的问题:检查excel文件是否已经存在
包:scTypeR
提交:c76db2eaab3bc86d6a3a0e24e5f885aaae402981
作者:Johannes Griss
日期:2020-12-29 20:09:10 +0100
提交的信息:

更新README，使用新的包名
包:scTypeR
提交:a1f7337667842506e5f6cc76ae72a73ea17fac45
作者:Johannes Griss
日期:2020-12-29 20:07:10 +0100
提交的信息:

合并拉请求#3从grisslab/开发开发
包:scTypeR
提交:c41bda4739a20cb0a346da77aaa02256d756b67f
作者:nttvy
日期:2020-12-29 01:49:20 +0100
提交的信息:

重命名方案
包:scTypeR
提交:864885 ec7ff787bf98b464fcc188c50693100b77
作者:nttvy
日期:2020-12-24 23:29:17 +0100
提交的信息:

在涉及包安装的代码块中添加eval = FALSe
包:scTypeR
提交:defaff2b9a1760939ef0c85b7e3130deb5d3bc0b
作者:nttvy
日期:2020-12-24 23:15:00 +0100
提交的信息:

更改向量比较以提高可读性
包:scTypeR
提交:8729 f9acf64c55f571afdf7e3bd990c264e9f1b8
作者:nttvy
日期:2020-12-24 22:01:20 +0100
提交的信息:

在报告进度时使用message()
包:scTypeR
提交:01 d6df5c6ca80d09ee58326eece130be9b4df0d2
作者:nttvy
日期:2020-12-24 21:26:27 +0100
提交的信息:

改进嵌套表达式
包:scTypeR
提交:9 bdd022806c12c7cff7e69383c4e0e8ce5e3db2b
作者:nttvy
日期:2020-12-24 20:58:42 +0100
提交的信息:

更改缩进样式以提高可读性
包:scTypeR
提交:191 a53788156648c8d4aace90a09eae5d4731e74
作者:nttvy
日期:2020-12-24 17:12:28 +0100
提交的信息:

将https://github.com/grisslab/scTypeR的分支“develop”合并为develop
包:scTypeR
提交:e52b32b4499d2b03f0175aea229f12e4ceb43999
作者:nttvy
日期:2020-12-24 17:11:58 +0100
提交的信息:

将单方法泛型转换为普通的旧函数
包:scTypeR
提交:1 c654e225b69481d1624f80e449106bceadc92f7
作者:Johannes Griss
日期:2020-12-23 20:50:28 +0100
提交的信息:

重新添加新闻文件与适当的内容。
包:scTypeR
提交:5 c273ba5e13fb4ff1f33f38f231694df7f600074
作者:nttvy
日期:2020-12-22 23:05:24 +0100
提交的信息:

使用访问器而不是@
包:scTypeR
提交:a940c5a9d01fe2b1d0254cbabec0dbe63b3b6242
作者:nttvy
日期:2020-12-22 22:01:41 +0100
提交的信息:

删除粘贴时使用猫，消息，停止
包:scTypeR
提交:6 c0f23354428e151ce50a784d61b6a9bcad0861a
作者:nttvy
日期:2020-12-22 17:30:32 +0100
提交的信息:

对非导出函数进行分组
包:scTypeR
提交:0 c71188ab78ae3dff15543c6723eaee0a4e82bff
作者:nttvy
日期:2020-12-22 15:35:46 +0100
提交的信息:

删除新闻文件
包:msdata
提交:d1cc52dd81c73526a1171d067b8b930363a373c2
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-29 18:36:57 +0100
提交的信息:

修复蛋白质组学手册页中的错误
包:CONSTANd
提交:7 d14ca626840addde75a3445179aa27f6daac53d
作者:j
日期:2020-12-29 13:26:47 +0100
提交的信息:

v0.99.5
包:CONSTANd
提交:33 f71f30e08cc5cb373d4ee673b228059d2af08b
作者:j
日期:2020-12-29 13:25:39 +0100
提交的信息:

在DESCRIPTION和vignette knirs选项中添加Cairo依赖(否则会出现X11字体错误)
包:CONSTANd
提交:9 f8b919b7de31f7c1be47fee0ecd920527b8c366
作者:j
日期:2020-12-29 12:34:18 +0100
提交的信息:

添加PXD000001_mztab.txt到gitignore
包:CONSTANd
提交:a73cec1497688323e1252077a992a5d19049c08a
作者:j
日期:2020-12-27 11:23:52 +0100
提交的信息:

添加。idea (pycharm)到gitignore
包:CONSTANd
提交:dbf26ea8cad3cd5568c3fd3fc495b763cd400f25
作者:j
日期:2020-12-27 11:00:21 +0100
提交的信息:

移动数据文件到新目录inst/extdata和函数。R变成inst/script
包:CONSTANd
提交:52 c81380bbeab602032771a97ad8411842375d67
作者:j
日期:2020-12-27 10:50:29 +0100
提交的信息:

加载魔术包，并使加载包可见的小插图包括魔术包在描述建议
包:CONSTANd
提交:16143 da5d70aaa12fe60c38cf81bb883bc9b3d0f
作者:j
日期:2020-12-27 10:08:11 +0100
提交的信息:

改变BugReports链接到github问题的URL
包:CONSTANd
提交:e2fcd14209d15dde51625039c4f8c79e759483b7
作者:j
日期:2020-12-27 10:06:41 +0100
提交的信息:

simplify在DESCRIPTION中建议导入
包:CONSTANd
提交:9695 bcfa60028dd3064a795e28cf377e393b6dd0
作者:j
日期:2020-12-27 10:06:23 +0100
提交的信息:

简化CONSTANd中的导入。限制型心肌病
包:CONSTANd
提交:218 b94c5cb8f7d1e77ea3583835b70aafb1dbaea
作者:j
日期:2020-12-27 10:02:39 +0100
提交的信息:

将R依赖关系调整到4.1
包:CONSTANd
提交:a9c558d22347a971e02d8412373b9bc62eee8a62
作者:j
日期:2020-12-27 10:02:01 +0100
提交的信息:

删除DESCRIPTION中的空字段
包:UMI4Cats
提交:2 cb4fa0c8116db4efe8ba168b90ea3b233f31c71
作者:Mireia Ramos
日期:2020-12-29 11:50:42 +0100
提交的信息:

版本撞
包:UMI4Cats
提交:21 c4847001c8ae210057da16a7f0cc8b8ee2fdcc
作者:Marc Subirana
日期:2020-12-15 16:53:20 +0100
提交的信息:

当切割位置> 0时，解决了消化片段的间隙
包:UMI4Cats
提交:e9e08e6258092158b6c973bd9a5fea8064427b53
作者:Mireia Ramos
日期:2020-12-02 11:20:59 +0100
提交的信息:

从诱饵槽中移除样本名称
包:qpgraph
提交:2033 ad56eacbbe20f7741dfe2364f3c8767839a9
作者:Robert Castelo
日期:2020-12-29 09:20:06 +0100
提交的信息:

修正了新矩阵1.3造成的错误。
包:metabCombiner
提交:ec93a63dc939b8876d187e4bc70ee31de64256c6
作者:哈尼·哈布拉
日期:2020-12-28 23:39:02 -0500
提交的信息:

新的fit_gam测试
包:metabCombiner
提交:a4783119bb3f99c61cbaf87b67a7fdede20a67cc
作者:哈尼·哈布拉
日期:2020-12-28 23:38:38 -0500
提交的信息:

增加了更多的matrixStats函数
包:metabCombiner
提交:3 fb6375cd44d15ffec5a23d0945510e916a65a0b
作者:哈尼·哈布拉
日期:2020-12-28 23:37:52 -0500
提交的信息:

1.1.2版本
包:metabCombiner
提交:9461 fc4a02201a067f202c27dbb7ce2c7738bbc0
作者:哈尼·哈布拉
日期:2020-12-28 23:36:33 -0500
提交的信息:

新增异常值显示选项
包:metabCombiner
提交:8 ca2dd94b360983eae5e03f2d0aa6a940ff15ec8
作者:哈尼·哈布拉
日期:2020-12-28 23:34:17 -0500
提交的信息:

新的基于箱线图的离群值检测方法
包:SeqArray
提交:cda59defa980d663df4e1122a25d9ae2b28ee539
作者:郑秀文
日期:2020-12-28 22:31:36 -0600
提交的信息:

重写seqSetFilterPos ()
包:cBioPortalData
提交:315 f9348a8e0d9726bc52ee7655a6d1bd826d4d0
作者:LiNk-NY
日期:2020-12-28 15:39:15 -0500
提交的信息:

版本撞
包:cBioPortalData
提交:59 ed353527e076a8d8463090d9bb951aabc6db41
作者:LiNk-NY
日期:2020-12-28 15:39:04 -0500
提交的信息:

使用与先前相同的名称，直到缓存失效
包:glmGamPoi
提交:356187219 adb40e3ea5bc6afdfd1bbcd3a712678
作者:const-ae
日期:2020-12-28 18:46:50 +0100
提交的信息:

碰撞版本和更新新闻
包:glmGamPoi
提交:3 b5c527f6db8f462539739ee47987ddc67410fdf
作者:const-ae
日期:2020-12-28 18:46:27 +0100
提交的信息:

添加引用
包:glmGamPoi
提交:533 ca910e6db6e4ce1211d9ce108b4e4a6391153
作者:const-ae
日期:2020-12-28 18:36:24 +0100
提交的信息:

在README中更新引用
包:ChemmineOB
提交:65661 f3cf624be8ec291309d2aefa790a61b7427
作者:呼兰
日期:2020-12-28 09:01:11 -0800
提交的信息:

删除未使用的针织依赖
包:OSCA
提交:7 e46bdace32b9dc861f250c43c98174c3c51caee
作者:GitHub Action
日期:2020-12-28 08:33:22 +0000
提交的信息:

合并git.bioconductor的分支“master”:packages/OSCA
包:OSCA
提交:ef34d5fc238cf7e856db9c72d134cd0c26a8c2df
作者:GitHub Action
日期:2020-12-28 08:33:19 +0000
提交的信息:

从书中总结最新的变化。
包:EGSEA123
提交:c823d414050ca10c78b12c40d317e6268aa9a97a
作者:Alhamdoosh
日期:2020-12-28 17:15:40 +1100
提交的信息:

修复了下载工作流数据文件的超时错误
包:cbaf
提交:f126c6ca5e4e1d7d204a3fd7c9d0cc47420a9806
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-28 04:08:06 +0330
提交的信息:

用openxlsx替换xlsx
包:xcms
提交:3 b7d0ef50647ed3986d138c5bdfbe32bc2bcbcad
作者:Johannes Rainer <5506112+jorainer@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-11 12:16:56 +0100
提交的信息:

将各种功能移动到MSnbase
包:xcms
提交:a175027dd3c3bd7394a20f6dbd7b016456e61fbb
作者:jorainer
日期:2020-12-11 10:45:39 +0100
提交的信息:

为macOS添加szip库
包:xcms
提交:c5678093973bbcb54829d8812218c913537ca7ec
作者:jorainer
日期:2020-12-11 10:03:26 +0100
提交的信息:

更新到netcdf 4.7.4
包:xcms
提交:68 bd752c0b439ad22a2f31ca7467254b94906ffc
作者:jorainer
日期:2020-12-11 08:53:16 +0100
提交的信息:

修新线路
包:xcms
提交:5 c528d5becc15ce7afbe7fad5b09166b2e8189ef
作者:jorainer
日期:2020-12-11 07:47:36 +0100
提交的信息:

在macOS上安装hdf5
包:xcms
提交:496935 e6f25c999c8ddd7b67dcec91160ca43bd7
作者:jorainer
日期:2020-12-10 22:00:47 +0100
提交的信息:

为macos安装预构建netcdf库
包:xcms
提交:9 d1d36a83d6428f1c2d866db29bf58bb7d826e27
作者:jorainer
日期:2020-12-10 21:15:43 +0100
提交的信息:

ci: macOS下使用R devel
包:xcms
提交:634 f9c33c8f8dcb61eeee0479d6800c18ec532a9
作者:jorainer
日期:2020-12-10 20:00:06 +0100
提交的信息:

强制安装devel版本
包:xcms
提交:3 a154b74f0e84a4a94b81ce1c4d28bfa5e3da269
作者:jorainer
日期:2020-12-10 19:26:28 +0100
提交的信息:

ci:强制安装magick和faahKO
包:xcms
提交:3 a259cd4b94e71c9867682ae782746b6dc879344
作者:jorainer
日期:2020-12-10 18:00:14 +0100
提交的信息:

refactor:移动各种方法到MSnbase -删除方法' align '， ' normalize '和' filterIntensity '，并从' MSnbase '导入' alignRt '， ' normalize '和' filterIntensity '用于' chromatography '和' MChromatograms '对象。
包:xcms
提交:35 f5e00ef8e28a539e2f7748cc2e076837823cef
作者:jorainer
日期:2020-12-03 18:35:45 +0100
提交的信息:

refactor: import Param class from ProtGenerics -从' xcms '中删除' Param '类，并从' ProtGenerics '中导入。
包:scp
提交:7 ad4fd62d4ea64e550982c1cae8b90eeaa6b7e7d
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 13:53:06 +0100
提交的信息:

更新README.md
包:scp
提交:301985117 f9a872a3a2f0ea01f2296f9fc5b5ccf
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 12:57:20 +0100
提交的信息:

Bump devel版本
包:scp
提交:8 f2f8fdbac92f10efcf54687496798adbdb065c2
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 12:56:22 +0100
提交的信息:

修复:新闻文件
包:scp
提交:8 ff12cea7563286b1f6fc7d6c251106f839ac907
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 12:52:50 +0100
提交的信息:

合并生物开发
包:scp
提交:5 cfb09a57009f55505694bb2f8f71541027bfa43
作者:Christophe Vanderaa
日期:2020-12-24 12:58:20 +0100
提交的信息:

重构:改变参数名
包:scp
提交:bc3b1071c95996da512329d1feb4d2aaaa482a88
作者:Christophe Vanderaa
日期:2020-12-07 18:40:38 +0100
提交的信息:

重构:重新实现每个单元计算的中值CV
包:scp
提交:e9039d61930e644227e26cb6d1dfc435ced2a534
作者:Christophe Vanderaa
日期:2020-12-04 10:38:00 +0100
提交的信息:

修复:'normalizeSCP'中的错误信息
包:scp
提交:5 ee4b69cf431dea4ccc112559ad34d50272b12d7
作者:Christophe Vanderaa
日期:2020-12-02 12:00:53 +0100
提交的信息:

构建:碰撞版本
包:scp
提交:2792311 da2f852ad07922dfa3f33fecc6aefb862
作者:Christophe Vanderaa
日期:2020-12-02 12:00:30 +0100
提交的信息:

deprecate:删除'transferColData'
包:scp
提交:30 df4ac603dde12341ebef93b665ddfb623e5eea
作者:Christophe Vanderaa
日期:2020-12-01 18:23:28 +0100
提交的信息:

重构:升级到0.1.1版本
包:scp
提交:0 f08a4b328c478562d99066bb57929e703d3f71f
作者:Christophe Vanderaa
日期:2020-12-01 18:21:49 +0100
提交的信息:

重构:重命名参数(issue#17)
包:scp
提交:490 c3abbb4f459fd888262a0d0b4482bfafed849
作者:Christophe Vanderaa
日期:2020-12-01 17:59:42 +0100
提交的信息:

专长:创建一个标准化的SCP包装器
包:scp
提交:9 c563af370b4bea43fb3fad030ca851f6a1c2ef4
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-27 12:41:29 +0100
提交的信息:

手动安装preprocessCore，只检查biodevel docker
包:gtrellis
提交:e1d9b562615df44c7eb6c72dc1bd510bb690f596
作者:顾祖光
日期:2020-12-27 12:11:11 +0100
提交的信息:

版本撞
包:gtrellis
提交:9 a2edf33ca855c93a298b75306b85ff40868b5d9
作者:顾祖光
日期:2020-12-27 12:10:23 +0100
提交的信息:

版本撞
包:gtrellis
提交:5 f89a1da5dae76d2969b06d99f47bc417b90c634
作者:顾祖光
日期:2020-12-27 12:08:53 +0100
提交的信息:

修正了重新分配差距的错误
包:gtrellis
提交:4 ccdaec7cd30840e62a8704eb7bc57a2a020a9f4
作者:顾祖光
日期:2020-05-30 09:36:38 +0200
提交的信息:

KB/MB -> KB/MB
包:OSCA
提交:9 a30dbfcce130dddc26f00f875ca4ba8a8d2ee26
作者:GitHub Action
日期:2020-12-27 08:32:13 +0000
提交的信息:

合并git.bioconductor的分支“master”:packages/OSCA
包:OSCA
提交:87 d2fa78771e1922760e95f4a59c7fe2f56ea50e
作者:GitHub Action
日期:2020-12-27 08:32:08 +0000
提交的信息:

从书中总结最新的变化。
包:customCMPdb
提交:0 cbce832c15f7bab075b20f1ce089a89800a5c17
作者:段玉珠
日期:2020-12-27 00:31:57 -0800
提交的信息:

更新元数据;跳转到1.1.2
包:customCMPdb
提交:ac8929f6e2de2d1b0b5a21f2fe2609af358dd6d0
作者:段玉珠
日期:2020-12-26 22:37:58 -0800
提交的信息:

在元数据中更改药物url
包:SeqArray
提交:16 ca7c161a002f926b566cb11a302ccd81258029
作者:郑秀文
日期:2020-12-27 00:33:35 -0600
提交的信息:

在seqSetFilter()中添加'ret.idx'
包:Rcwl
提交:de2678b7a90930c920fe075226266f13ce46e03a
作者:胡本图
日期:2020-12-26 16:33:38 -0500
提交的信息:

跳过窗户
包:QFeatures
提交:52709 a66262fb9a887aff5b593129e9d804158b2
作者:Laurent Gatto
日期:2020-11-15 18:39:25 +0100
提交的信息:

文档:更新自述文件
包:QFeatures
提交:e5ed718a5ab27556940cdd4a7851683c06b77257
作者:Laurent Gatto
日期:2020-11-15 17:43:50 +0100
提交的信息:

文档:改进引言的第一段
包:QFeatures
提交:613 e7697cf638ad8ce305c1b91c07318c5622ddc
作者:Laurent Gatto
日期:2020-11-04 22:45:24 +0100
提交的信息:

ci:还要检查RELEASE
包:QFeatures
提交:cea5d2f4f28bbb8c6420441ba30e6edab7f7deeb
作者:Laurent Gatto
日期:2020-11-04 21:53:13 +0100
提交的信息:

修复:错别字在小插图
包:咆哮
提交:da562134f0032850dc0fbd5aab9831f77d1c12ec
作者:LTLA
日期:2020-12-26 00:46:50 -0800
提交的信息:

将额外的参数转换为显式槽。将NNGraphParam拆分为共享/非共享子类。
包:咆哮
提交:83662700 b1257372e4709df29135a5241a52deca
作者:LTLA
日期:2020-12-25 21:19:31 -0800
提交的信息:

集中中心=处理到FixedNumberParam。
包:DelayedMatrixStats
提交:d7243fe669eea1de58cf11f9e7f3e74d6658653c
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-26 01:44:07 -0800
提交的信息:

resync with DelayedArray 0.17.6
包:DelayedArray
提交:b105b6e7a523b3519574d6acf1e66fe2bbea4cfc
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-26 01:35:22 -0800
提交的信息:

更新DelayedUnaryIsoOpWithArgs单元测试
包:食物
提交:424 c5ce8f07548b85b0f002b3b51c655aa7957d6
作者:LTLA
日期:2020-12-25 20:38:58 -0800
提交的信息:

为S(C)Es增加了包装bluster::clusterRows的clusterCells。
包:DropletUtils
提交:923 fdee2a893fe263a771c0a5f102d437e4946cb
作者:LTLA
日期:2020-12-25 17:09:01 -0800
提交的信息:

将所有接受矩阵的函数转换为S4泛型。增加相应的SE方法。
包:HiCDCPlus
提交:07年afe94f6b400715f4c93b91f8e45cb5bf5fe15d
作者:msahin
日期:2020-12-25 18:36:50 -0500
提交的信息:

提高Windows的稳定性
包:AHPathbankDbs
提交:fbe0e59fc2f828fa41f3d96fc9159e505c65021d
作者:西田kozo
日期:2020-12-26 08:23:47 +0900
提交的信息:

更新版本
包:OSCA
提交:dd13b13e664e0e9393b6ec68ed094b3c735aa6a1
作者:GitHub Action
日期:2020-12-25 20:22:34 +0000
提交的信息:

合并git.bioconductor的分支“master”:packages/OSCA
包:OSCA
提交:2 e42469d6450f44332f1b702415d72cd33b01351
作者:GitHub Action
日期:2020-12-25 20:22:31 +0000
提交的信息:

从书中总结最新的变化。
包:亲
提交:237 bf44365ae8251a2736cd594a14c2a6f4a55fc
作者:AIB-KQC
日期:2020-12-26 00:33:20 +0800
提交的信息:

提交
包:ExploreModelMatrix
提交:3030 ee7ab97dbf6534f0a7534e155c8c6d3a8540
作者:Charlotte Soneson
日期:2020-12-25 13:53:46 +0100
提交的信息:

从csoneson/fixnewline合并拉请求#29修复。addnewline
包:ExploreModelMatrix
提交:4 d2ffc1aef429d3858130c82cd21e0c9946484f1
作者:Charlotte Soneson
日期:2020-12-25 12:43:13 +0100
提交的信息:

修复.AddNewLine
包:ExploreModelMatrix
提交:7 e5218dec2fa604c88065292417c293db5ef80bb
作者:Charlotte Soneson
日期:2020-12-12 16:24:07 +0100
提交的信息:

解决测试
包:ExploreModelMatrix
提交:c25ceb6cece02b291491d421cbc6daeba42e2383
作者:Charlotte Soneson
日期:2020-11-26 21:50:14 +0100
提交的信息:

空白行
包:ExploreModelMatrix
提交:bf3486e3868e1184a05779dcfcab5ec771de6589
作者:Federico Marini
日期:2020-11-26 21:35:09 +0100
提交的信息:

合并拉请求#28从csoneson/curlfix修复ragg + pkgdown正确部署
包:ExploreModelMatrix
提交:8536239395567 f2275c911f1c5d6edad5b0993e0
作者:Federico Marini
日期:2020-11-26 21:07:02 +0100
提交的信息:

固定ragg + pkgdown正确部署
包:ExploreModelMatrix
提交:fcb3af0d1dc1337296f43688dc0cd84aa144065d
作者:Federico Marini
日期:2020-11-26 20:47:52 +0100
提交的信息:

修复GHA上的RCurl问题
包:ExploreModelMatrix
提交:ee1683a482334c804f73880387e7f632827ea358
作者:Federico Marini
日期:2020-11-26 19:25:00 +0100
提交的信息:

修复GHA上的RCurl问题
包:ExploreModelMatrix
提交:b770c6a5cbe1f1def77c8d813209db360d925d10
作者:Charlotte Soneson
日期:2020-11-02 10:53:59 +0100
提交的信息:

将特拉维斯
包:ExploreModelMatrix
提交:5417192 eddc642102feee150e38428d245b9295c
作者:Charlotte Soneson
日期:2020-11-01 08:12:09 +0100
提交的信息:

修复GHA
包:ExploreModelMatrix
提交:5 a4b5eb31bb35a6df696315eb201bd1dc4e7bd3e
作者:Charlotte Soneson
日期:2020-10-28 21:46:50 +0100
提交的信息:

在GHA中使用R-devel
包:OSCA
提交:1 c470dd13a108e672da7fee74a6c1c5e95f06fbb
作者:GitHub Action
日期:2020-12-25 08:33:13 +0000
提交的信息:

合并git.bioconductor的分支“master”:packages/OSCA
包:OSCA
提交:4 a93d6d057793481bbdc26f258d16ddf251078bf
作者:GitHub Action
日期:2020-12-25 08:33:08 +0000
提交的信息:

从书中总结最新的变化。
包:DropletUtils
提交:2 ad03600a1c5feb30af3e4773c0d408c3764ff39
作者:LTLA
日期:2020-12-24 21:22:29 -0800
提交的信息:

清理链接，碰撞版本和日期，更新新闻。
包:DropletUtils
提交:4 ec825ef0d63644007f892044d8981c8f71dce9c
作者:LTLA
日期:2020-12-24 20:55:38 -0800
提交的信息:

修复了ambientContribControl中多个基因集的错误。重命名测试文件。
包:DropletUtils
提交:cc5b2fab0019e24e08e7271ba8d7e6a8998a98c9
作者:LTLA
日期:2020-12-24 20:31:22 -0800
提交的信息:

重命名了清洗函数本身，重点放在聚合物的去除上。更新新功能的测试。
包:BioTIP
提交:d466990b1732ba8e75ea2c88fa73a577f000a773
作者:sun98
日期:2020-12-24 09:33:15 -0800
提交的信息:

合并远程跟踪分支“上游/主”包更新的新版本
包:BioTIP
提交:5 cf12b61eda968f3243e9ac600fe91dd520c3884
作者:sun98
日期:2020-12-24 09:23:42 -0800
提交的信息:

修复5.0错误
包:BioTIP
提交:9200 c7dbd751cb19f1a2882ee25a767b90d8f049
作者:sun98
日期:2020-12-16 11:54:38 -0800
提交的信息:

BioTIP R鳕鱼5.0
包:BioTIP
提交:890 e04beb5639418cf492670443f40fed6a208a8
作者:sun98
日期:2020-12-16 11:53:59 -0800
提交的信息:

BioTIP R鳕鱼5.0
包:BioTIP
提交:ea19911c4f977e1b815549d0181c3e457433d89d
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-29 12:36:54 -0500
提交的信息:

在cor.shrink()中更改X_sds，增加更多解释
包:BioTIP
提交:8 bd69dba33917442662c3cffe7429d839648701b
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-29 11:45:57 -0500
提交的信息:

cor.shrink() update X_sds 0 case X_sds[X_sds == 0] =0 change to: X_sds[X_sds == 0] = min(X_sds[X_sds > 0]) /2
包:BioTIP
提交:98571 c6140967839c7f05efbb667a2ca174138f8
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:51:41 -0700
提交的信息:

删除.DS_Store
包:BioTIP
提交:a16bb71fa0d56a7e2a1e4981340dbaf26bc3741c
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:51:22 -0700
提交的信息:

删除.DS_Store
包:BioTIP
提交:40069006342 f84dce03c6171dac675ffe8d5f508
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:51:16 -0700
提交的信息:

删除.RData
包:BioTIP
提交:71 d75b5c3890fc9715ef4ca0210c94caab2f1956
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:51:06 -0700
提交的信息:

删除.gitignore
包:BioTIP
提交:9 f9e7090d00ce3ebbd84551bc6aaed66c4e1f1b5
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:50:38 -0700
提交的信息:

删除.DS_Store
包:BioTIP
提交:72 f588c13be07cbdaec2f5f0760c49f4de6b066f
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:50:13 -0700
提交的信息:

删除.Rhistory
包:BioTIP
提交:89 dd080ee5085c85ab4941886e4a34c36f2f462f
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:49:57 -0700
提交的信息:

删除.DS_Store
包:BioTIP
提交:a58637680b977c2709f73e81c907b801b10716d2
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:49:34 -0700
提交的信息:

删除.RData
包:BioTIP
提交:80398 dece0c054ce4ecfa3c27da5fbc058990268
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:49:14 -0700
提交的信息:

删除.Rapp.history
包:BioTIP
提交:826 d4c70f3aa3033811f14715d978cc5a85ccecc
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:49:01 -0700
提交的信息:

删除.Rhistory
包:BioTIP
提交:932 d8cbb427b4f2642855ee742451a5c09ebceaf
作者:YangGroup <44039446+xyang2uchicago@users.noreply.github.com>
日期:2020-10-10 19:48:29 -0700
提交的信息:

删除.gitattributes
包:Rcwl
提交:538891 a4a91a97d445dbfcc77e8f63c3bdbd5cf9
作者:胡本图
日期:2020-12-24 12:24:22 -0500
提交的信息:

在stepParam中为子工作流添加更多插槽
包:ttgsea
提交:70 ff8b55dfa08c7772a3f60b61b81981833407fe
作者:董敏贞
日期:2020-12-25 00:41:46 +0900
提交的信息:

更新
包:HiCDCPlus
提交:269 c32b7af5913848745ee3889afdd378fda0d3e
作者:msahin
日期:2020-12-24 02:37:07 -0500
提交的信息:

从0.99.2引入Bioconductor评论
包:gdsfmt
提交:0 d2424caf4c6896f9127e929109631c14b5c38c2
作者:郑秀文
日期:2020-12-24 01:29:47 -0600
提交的信息:

新的is.sparse.gdsn ()
包:DropletUtils
提交:96 b46701fa425a5f3744a474df278ad34ddaebe2
作者:LTLA
日期:2020-12-23 22:35:16 -0800
提交的信息:

在文档中更通用地引用标签而不是HTO。
包:rtracklayer
提交:ce7efb66d96f68b204c26d51111b5d4acea07ebb
作者:Michael Lawrence
日期:2020-12-23 21:49:39 -0800
提交的信息:

实际上是导入restfulr
包:EnMCB
提交:4 eebe95817654e98204205333f09fa3f5064711a
作者:于昕MacBook pro
日期:2020-12-24 13:22:44 +0800
提交的信息:

合并git.bioconductor的分支“master”:packages/EnMCB
包:EnMCB
提交:45 ec756e5dca27cb371eb5806dc6ee02926b551d
作者:未知
日期:2020-12-24 02:33:47 +0800
提交的信息:

1.3.1大于12
包:Rcwl
提交:4 ff01a5ac83bde17e439e418c16308ed69058b97
作者:胡本图
日期:2020-12-23 21:11:05 -0500
提交的信息:

修复cwltool-3.0中的测试
包:rtracklayer
提交:e68d6d1623fa09b85037540a6ce1805f540999a6
作者:Michael Lawrence
日期:2020-12-23 18:03:07 -0800
提交的信息:

将restfulr移动到导入
包:rtracklayer
提交:7 b794d0f491a20cb0b28bafef21e8edb8713cb10
作者:Michael Lawrence
日期:2020-12-23 18:02:42 -0800
提交的信息:

修复browseGenome ()
包:Rcwl
提交:0687 c7fd736770fe648475a3cb2050d5b437cb1b
作者:胡本图
日期:2020-12-23 15:24:19 -0500
提交的信息:

在运行basiliskStart前添加检查
包:蛇怪
提交:a3b5b63833de862d30ae6a92dc9dd7918e307bae
作者:LTLA
日期:2020-12-23 12:12:57 -0800
提交的信息:

触发重建的碰撞版本和日期。
包:Rcwl
提交:553 add2cfcc3226fafdc2faa76daa94fcf50b03f
作者:胡本图
日期:2020-12-23 15:02:19 -0500
提交的信息:

move basiliskStart运行cwl
包:Rcwl
提交:df6f66f71ca639c876e14d6ea7a9adb0bc185da8
作者:胡本图
日期:2020-12-23 14:56:49 -0500
提交的信息:

更新蛇怪
包:basilisk.utils
提交:20 de5b092f5d2f186509eabf79ce3e67b208918c
作者:LTLA
日期:2020-12-23 11:08:46 -0800
提交的信息:

正式放弃win32位支持。
包:AHPathbankDbs
提交:c81cb3091e0d3c10d710bf5eff5f682a66827257
作者:西田kozo
日期:2020-12-20 20:25:54 +0900
提交的信息:

更新许可证
包:AHPathbankDbs
提交:2 fb26048c87f1750b73f2fb8e856710e8e85c768
作者:西田kozo
日期:2020-12-20 03:51:36 +0900
提交的信息:

更新描述
包:EnMCB
提交:9973 fdb60f3c9b0b53c84cc601a55a5a4b7b080a
作者:未知
日期:2020-12-24 02:33:47 +0800
提交的信息:

合并git.bioconductor的分支“master”:packages/EnMCB
包:EnMCB
提交:c015de5687ea9a10bce104e64e1bf4b36a79b363
作者:未知
日期:2020-12-24 02:16:28 +0800
提交的信息:

1.3.1 23 _25
包:EnMCB
提交:ac66ab05b77b939a7ec4cd29a5e68b6f7b0be5a6
作者:未知
日期:2020-12-24 02:16:28 +0800
提交的信息:

1.3.1 23大于
包:pasilla
提交:d3b4885d48aab3588af1da975cae3e60e123f80c
作者:areyesq89
日期:2020-12-23 19:08:31 +0100
提交的信息:

删除已弃用的对象并更新文档。
包:swfdr
提交:10 e4bb48b3bd36658344ae9a1c1a9c7b90fafcda
作者:Simina M. Boca
日期:2020-12-23 10:46:10 -0500
提交的信息:

更新版本
包:swfdr
提交:5 d6750b2009cb08002f481f59b734df2b438dc8c
作者:Simina M. Boca
日期:2020-12-10 14:56:17 -0500
提交的信息:

版本变更为1.18.0
包:swfdr
提交:f9832f6eb0332f5e9de4637eb50a41492e19cb4f
作者:Simina M. Boca
日期:2020-12-10 14:38:00 -0500
提交的信息:

更新版本到1.18.0，以便可以在BioC上更新
包:swfdr
提交:e93b6768f9729a4b39b25c7811c8364ac4725271
作者:Simina M. Boca
日期:2020-10-16 16:23:48 -0400
提交的信息:

更新版本号
包:swfdr
提交:16 d802720449d8189669c5e8e7d1f4d0a663172b
作者:Simina M. Boca
日期:2020-08-24 21:07:30 -0400
提交的信息:

从tkonopka/master合并拉请求#4在帮助页中关于lm_pi0, lm_qvalue返回值的更多详细信息
包:swfdr
提交:00 d9ee5a2e416859eb82d370f7d4a23c673ff710
作者:tkonopka
日期:2020-08-19 19:10:35 +0100
提交的信息:

关于lm_pi0, lm_qvalue返回值的更多详细信息
包:ComPrAn
提交:dafda3ab8d29db7408761282f395c66228326517
作者:彼得雷乌斯将军
日期:2020-12-23 12:52:10 +0100
提交的信息:

正确的系统文件位置
包:ComPrAn
提交:33 f568432cf212f9ff2da7312d9737babfe5f838
作者:彼得雷乌斯将军
日期:2020-12-23 12:50:28 +0100
提交的信息:

删除.DS_Store文件
包:SCArray
提交:42116685 a90c3322093398e4eb46b39151c3cafb
作者:郑秀文
日期:2020-12-23 04:18:19 -0600
提交的信息:

根据评论更新
包装:单
提交:db2a5415501e345a8f4dba02c86a2495f19460e7
作者:LTLA
日期:2020-12-22 22:58:34 -0800
提交的信息:

清理了关于手动基因=的文档。
包:limma
提交:a278ed136c1284ea5e629020830a226c7d6df552
作者:Gordon Smyth
日期:2020-12-23 14:23:04 +1100
提交的信息:

limma 3.47.3 -为read.idat()添加新的参数“path”和“bgxpath”。- read.idat()现在在调用illuminaio读取函数之前检查是否存在输入文件。
包:cBioPortalData
提交:74 ad66615c423163eb279b2b2a19c15fd162e740
作者:LiNk-NY
日期:2020-12-22 18:23:57 -0500
提交的信息:

版本撞
包:cBioPortalData
提交:7770 e313e1f83d74b5bd556a3ab70a8995446929
作者:LiNk-NY
日期:2020-12-22 16:46:41 -0500
提交的信息:

添加和合并其他临床数据
包:curatedTCGAData
提交:56225 c92c4af2dbc1868939645616b6241287bf4
作者:LiNk-NY
日期:2020-12-22 17:41:50 -0500
提交的信息:

版本撞
包:curatedTCGAData
提交:bf8ed6fed7a4cba6095253896f6e2587ab472f89
作者:LiNk-NY
日期:2020-12-22 17:41:42 -0500
提交的信息:

使用'cTD/v2/resource'资源名的basename
包:DmelSGI
提交:2 b6365d4682ebda39dce2c61743dcb18cdebe92a
作者:Lori Shepherd
日期:2020-12-22 16:04:18 -0500
提交的信息:

Undeprecate
包:RNAinteractMAPK
提交:7 b7b5dc3b5a87a77b09d256490dc07286393e4d6
作者:Mike Smith
日期:2020-12-22 15:01:37 +0100
提交的信息:

yaml中的错别字
包:RNAinteractMAPK
提交:14 cf6e39500e5b3f4d2bf4b2a99ed5e9e9c5cdc7
作者:Mike Smith
日期:2020-12-22 15:00:24 +0100
提交的信息:

yaml中的错别字
包:RNAinteractMAPK
提交:3720 df50c55f5c79e0e8952333f51c239db48286
作者:Mike Smith
日期:2020-12-22 14:57:40 +0100
提交的信息:

增加工作流程，与Bioconductor保持同步
包:ComplexHeatmap
提交:3612 bf570cee691f7437c7e547bfb00f85b36f1a
作者:顾祖光
日期:2020-12-22 10:48:09 +0100
提交的信息:

Anno_mark():索引被重新排序
包:TraRe
提交:bf8214ac0dea90a76bb24edfa105159444e1e47f
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-22 10:02:29 +0100
提交的信息:

0.99.7版本碰撞
包:ORFhunteR
提交:3 ee0443a5171cafca12f3ac56df30d864cd2dca2
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-12-22 11:08:53 +0300
提交的信息:

撞
包:RNAseq123
提交:d2078fadf80ad805efe41a7515c6a5f20c7352ef
作者:Matthew Ritchie
日期:2020-12-22 18:58:14 +1100
提交的信息:

修正了设计矩阵小插图的格式问题
包:PoDCall
提交:07年d5d622a52e32c5fe2722c7e8a866b7e394aaec
作者:Hans Petter Brodal
日期:2020-12-22 08:54:08 +0100
提交的信息:

撞版
包:ORFhunteR
提交:f316c15bf3d056027b5b21b24112b972028caacc
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-12-22 10:50:02 +0300
提交的信息:

添加RcppExports。R
包:PoDCall
提交:564 f1642bb1cfc5cf2f64be707d2abcf825f850d
作者:Hans Petter Brodal
日期:2020-12-22 08:37:27 +0100
提交的信息:

更正后的作者姓名
包:DropletUtils
提交:73 e0536d7990279e04473285e9c3cc4dcc1ae7d9
作者:LTLA
日期:2020-12-21 23:02:57 -0800
提交的信息:

合并分支“编辑”
包:DropletUtils
提交:a8b4ed02a770971affc2f4d9e09531892bf86962
作者:LTLA
日期:2020-12-21 23:02:06 -0800
提交的信息:

碰撞版本和日期，更新新闻。
包:DropletUtils
提交:81772 c55bacd18d2c102590bf9a6cc419350c708
作者:LTLA
日期:2020-12-21 22:18:22 -0800
提交的信息:

重构ambientContribControl以避免密集的矩阵创建。
包:DropletUtils
提交:04936 a1b5639190ec14541a866543a61d402af14
作者:LTLA
日期:2020-12-21 22:17:01 -0800
提交的信息:

允许向量输入到ambientContribSparse。
包:DropletUtils
提交:d68368fd5c9af86a98e929ad9da4929423dc043c
作者:LTLA
日期:2020-12-21 22:06:51 -0800
提交的信息:

增加了更多的cleanHashDrops选项，扩展测试。
包:DropletUtils
提交:1 eb0899394a7f900225fad940be8e21ef9cf0364
作者:LTLA
日期:2020-12-21 21:21:17 -0800
提交的信息:

重命名所有与环境相关的函数以保持一致性。不要费心自动生成ambient= in ambientContribSparse。
包:DropletUtils
提交:c9008f061e2384c60d7640642234986e9b8dd6ab
作者:LTLA
日期:2020-12-21 15:25:26 -0800
提交的信息:

集中定义操作系统安全的BPPARAM。
包:DropletUtils
提交:19 d3038e7b4d7241e4a4483e111e1e24d7868651
作者:LTLA
日期:2020-12-21 15:24:06 -0800
提交的信息:

次要文档编辑。
包:DropletUtils
提交:535 e8e1de690bb97cbaef4bfce71cdf2373aa969
作者:LTLA
日期:2020-12-21 15:00:23 -0800
提交的信息:

增加了一个显式函数来计算环境缩放。
包:DropletUtils
提交:e09ee49580cdd062ffe92bcf2aa8c9855bb78ef4
作者:LTLA
日期:2020-12-21 12:32:23 -0800
提交的信息:

重组maximumAmbience代码，以获得更多的可伸缩性，可重用。
包:DropletUtils
提交:8 b2f5fc3e41484a04612eb7d3e6f8196c5568398
作者:LTLA
日期:2020-12-21 11:29:58 -0800
提交的信息:

增加了实用程序，以清除不必要的液滴在HTO数据。
包:马尔
提交:a23d25f45d3f2f5f794b473d834ef565c2eca068
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 18:46:06 -0700
提交的信息:

alpha的硬编码解决
包:马尔
提交:2 ff571162ad87702f5e230c5433ae2ebba28cc41
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 18:45:35 -0700
提交的信息:

版本撞
包:马尔
提交:69 e3339da6ccd54710f97cb6ca2d5654ac4faa56
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 18:29:19 -0700
提交的信息:

版本撞
包:马尔
提交:5 d81d42fd5f1796c8a0c86af94b8688e6fdfbc50
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 18:28:51 -0700
提交的信息:

alpha固定的硬编码
包:马尔
提交:320864 cc37a0293f8653a7449f1c177dbaf6f5fd
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 18:01:20 -0700
提交的信息:

版本撞
包:马尔
提交:6 b48db79f9d0ef4a850289060b32c86acdd8689b
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 18:00:30 -0700
提交的信息:

版本撞
包:马尔
提交:b1a739f107774ebce0024622d60b18a00f3c8cc6
作者:Tushar
日期:2020-12-21 17:21:54 -0700
提交的信息:

合并远程跟踪分支“上游/主”alpha解决硬编码。
包:马尔
提交:09145 ba72ffe74d990601fc1b200f7422cb271fd
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 17:09:31 -0700
提交的信息:

alpha固定的硬编码
包:马尔
提交:f297f0da077b9eadd01136b31cab66c75be5559c
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 16:41:47 -0700
提交的信息:

通用的α
包:马尔
提交:72768 fd2f09f7b7e5afc9908a7a6e08db57a08f8
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 16:39:11 -0700
提交的信息:

通用的α
包:马尔
提交:c468c68a79f972c3aa85390bbd59636fac659490
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-09 10:51:58 -0700
提交的信息:

更新README.md
包:马尔
提交:0 d61f5a225a64d9e2dfcd3732838d49300aeed79
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-09 10:51:32 -0700
提交的信息:

更新.travis.yml
包:马尔
提交:5 c0d6eeedb80cbfc8e6b652752437dc9da6dd35d
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-09 10:37:23 -0700
提交的信息:

更新.travis.yml
包:马尔
提交:6 c02ebca37aa9146b1266ebda94de31095c1c508
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-09 10:33:28 -0700
提交的信息:

更新.travis.yml
包:马尔
提交:6 a317c5a4cad70d939becc27e66d9eb1809e6ef0
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-09 09:30:00 -0700
提交的信息:

合并拉请求#1从Ghoshlab/开发README-devel更新
包:马尔
提交:cdde80dbaa20b5861e9eb9f102853a1c37ae605a
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-09 09:28:52 -0700
提交的信息:

README-devel更新
包:马尔
提交:67145098 ac56ec582ca29194e97386d93759e1ec
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-09 09:16:58 -0700
提交的信息:

Bioconductor更新
包:马尔
提交:99 c6472a85a2d8e4664c55222e210ec6f27df963
作者:Tusharkanti Ghosh <44294394+tghosh30@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-09 09:16:22 -0700
提交的信息:

Bioconductor安装更新
包:指南针
提交:e875db259b4cccc395983c2ea8d097b07759857c
作者:Greg Finak
日期:2020-12-21 16:20:39 -0800
提交的信息:

撞
包:指南针
提交:448 a6c94c6138cc00e28965e0d6b7378b8c700c7
作者:Greg Finak
日期:2020-12-21 16:20:23 -0800
提交的信息:

修复警告和测试错误
包:cbaf
提交:c75da2d8f6736acdfed32aae23524613c5d19d2d
作者:Arman_Shahrisa
日期:2020-12-22 02:36:26 +0330
提交的信息:

打印信息的改进!
包:ORFhunteR
提交:259 b5c359b390b30d5f9fa19f060a4ba856cecfd
作者:rfctbio-bsu <68079203+rfctbio-bsu@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 20:53:18 +0300
提交的信息:

撞
包:ORFhunteR
提交:57 bb2eb37101b4f1922b96e4a70b711cba0cbc5e
作者:rfctbio-bsu <68079203+rfctbio-bsu@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 20:50:59 +0300
提交的信息:

删除旧文件
包:ORFhunteR
提交:45 de324bda5402a5b8fd024ac6f4b77acab186c7
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-12-08 02:31:01 +0300
提交的信息:

Upd:文件清除+默认模型文件
包:ORFhunteR
提交:e823edb7c1dbc8a4d116e3c929863d12d42b153d
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-12-07 01:56:31 +0300
提交的信息:

Upd:新版本的小插图更新
包:ORFhunteR
提交:4053 cdc3e5916448b4c99df2a91d6683ae888e78
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-12-07 01:55:26 +0300
提交的信息:

unmute detectCores() - cmd检查问题得到解决
包:ORFhunteR
提交:01 df8da6fb655bc4bd8598b0cf674345a3c93239
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-12-07 01:54:19 +0300
提交的信息:

gz到loadtrExper()，更新默认模型路径
包:ORFhunteR
提交:39254 c7fcdc534a9cd4587b36157072dab61d38c
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-12-07 01:52:55 +0300
提交的信息:

静音图+导入data.table
包:ORFhunteR
提交:b11ced78a5be09ef7f8db3308bf23572b9d1778f
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-11-24 12:25:22 +0300
提交的信息:

变量名称固定，导入添加
包:ORFhunteR
提交:db52eaf91931e757b96df7441f4a22a7a83e43ac
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-11-18 12:44:04 +0300
提交的信息:

重命名为.rd，添加了格式化
包:ORFhunteR
提交:cb011f99305e3e20ee41c7b363681c6c9e82b72f
作者:rfctbio-bsu
日期:2020-11-18 12:40:43 +0300
提交的信息:

乌利希期刊指南依赖性
包:ORFhunteR
提交:692 e2be3fa902a89611addf2b0e6d674e23e8166
作者:rfctbio-bsu <68079203+rfctbio-bsu@users.noreply.github.com>
日期:2020-11-13 22:03:33 +0300
提交的信息:

合并拉请求#1从VGrinev/master ORFhunteR 0.99.2
包:ORFhunteR
提交:6 b1a28142a5ab8609c3fcfb60334dfa6d30c0634
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-12 20:40:30 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:6 b59cfe52cb1c9308abe9b3f3d8cee8e8c9b9285
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-12 20:39:50 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:4 e0dc6d6f37994a9d6440fb056a3a92e22e0542e
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-12 12:05:27 +0300
提交的信息:

更新classifyORFsCandidates。R
包:ORFhunteR
提交:a2177644324420341c1f1d7295172a82469035c4
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:34:24 +0300
提交的信息:

删除loadPackages。R
包:ORFhunteR
提交:99 c4a079c93cdadf4984b601fc9dcc016152ba1f
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:33:53 +0300
提交的信息:

通过上传添加文件
包:ORFhunteR
提交:0606 b5f076e16abdaccbc91e730a22c321d2b511
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:33:24 +0300
提交的信息:

删除translatorORFs.r
包:ORFhunteR
提交:0168 d58eb2f2ea215554dd9e47a2b60668a631bb
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:33:18 +0300
提交的信息:

删除sequenceORFs。R
包:ORFhunteR
提交:f4eaf250773f9b633796cb10344b138c21dc983c
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:33:10 +0300
提交的信息:

删除loaderTrExper.r
包:ORFhunteR
提交:2 b5b78f5f6e8de8838f8bf324e9a70bd7820e786
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:33:03 +0300
提交的信息:

删除finderPTCs.r
包:ORFhunteR
提交:fe9cbec5cace6fda8c937d7921b802424d3d6224
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:32:55 +0300
提交的信息:

删除finderORFs.r
包:ORFhunteR
提交:4 b1520035dc629b167c9d75d80c6b00ade87729d
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:32:45 +0300
提交的信息:

删除filterEnsemblORFs.r
包:ORFhunteR
提交:5 fff362e79213ad728e208bbd11edc94a52ea716
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:32:38 +0300
提交的信息:

删除codonStartStop.r
包:ORFhunteR
提交:23 b025c89ac185bd81c18d4f7c8dfd7719aff73c
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:32:29 +0300
提交的信息:

删除annotatorORFs.r
包:ORFhunteR
提交:99 a7b31ac393ce1b88bb5d559835432dba410ec6
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:32:19 +0300
提交的信息:

删除Vectorising_RNAs_V。R
包:ORFhunteR
提交:e08cd45652363a781b1867e4dce90c28f0ca9919
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:32:06 +0300
提交的信息:

删除RcppExports。R
包:ORFhunteR
提交:94 e3b405a95e661c8e5adafceac2d94a964eb8a9
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:31:28 +0300
提交的信息:

通过上传添加文件
包:ORFhunteR
提交:0737 e4f6840e72b3d08bb7b423a27084f15d68c3
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:30:56 +0300
提交的信息:

删除Predicting_model。R
包:ORFhunteR
提交:05933341 e78ec9206cc5520242b5e4838e748178
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:30:46 +0300
提交的信息:

删除.onUnload.R
包:ORFhunteR
提交:5 fe86a37b5047fe3b9a29f69dcea4168f72fa7e0
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:30:13 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:b899cab391753f04549609f4157601cc1d525113
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-11-11 08:29:34 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:a7ed814d7b7c15788f13ee496d22ba02b133650f
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-29 10:46:39 +0300
提交的信息:

更新codonStartStop.r
包:ORFhunteR
提交:fda1820f79aced96425625a9cfe3b95c3c66b611
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-29 10:17:37 +0300
提交的信息:

更新loaderTrExper.r
包:ORFhunteR
提交:f558dd409435895a404e746bc2934fc225462036
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-28 20:44:47 +0300
提交的信息:

更新loaderTrExper.r
包:ORFhunteR
提交:e0ab4e0ebe0f4e6f0e3171ea406da33bb996a58b
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-28 18:40:10 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:c742a58783b572a13e8cc504c5d5828cd0c6de0e
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-27 17:49:47 +0300
提交的信息:

更新translatorORFs.r
包:ORFhunteR
提交:446034 d28bea5e4960c30cc715a663c8072153f0
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-27 17:49:05 +0300
提交的信息:

更新translatorORFs.r
包:ORFhunteR
提交:9 aa0ed3a1103fffb5491241eeda8970aff84e962
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-27 17:31:44 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:512 f1ee9c53b2e91c4dbf5f2c3df76379ce13b40
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-27 17:31:25 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:6704 a4524d3d408df559edb0b77b131c0cb69d1c
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-27 17:30:49 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:e29aa28b4f66df9c9f30bbac25ad1620c0b464bb
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-27 17:30:19 +0300
提交的信息:

更新README.md
包:ORFhunteR
提交:d5a889c9a6f558cac1703b620ff9d5127a146d64
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-25 17:24:54 +0200
提交的信息:

删除sgdhfh
包:ORFhunteR
提交:6 e95b4c4bbcc58a6563a3cc7fdef5fb14975b8e5
作者:Vasily V. Grinev
日期:2020-09-25 17:24:40 +0200
提交的信息:

创建sgdhfh
包:TraRe
提交:5 ac2f9dbbba9f779f6395c1e9b0d772c9852b001
作者:Jesús de la Fuente Cedeño
日期:2020-12-21 23:07:02 +0100
提交的信息:

版本了
包:NanoStringNCTools
提交:82 d41fd6e8405c92fac6d1c52e10e86437f88c16
作者:NicoleEO
日期:2020-12-21 13:53:16 -0800
提交的信息:

改回版本
包:GeomxTools
提交:3512 b5565d3aaa97cfc8566b96c444dd92ee7d8b
作者:NicoleEO
日期:2020-12-21 13:48:57 -0800
提交的信息:

改变版本
包:指南针
提交:f7d8dd2dd1c22c0661174826195fdb3b786441f9
作者:Greg Finak
日期:2020-12-21 13:09:27 -0800
提交的信息:

重建文档
包:指南针
提交:19 f11e3994016313d0b92c2b3370996f4f11a291
作者:Greg Finak
日期:2020-12-21 13:03:59 -0800
提交的信息:

撞
包:指南针
提交:19099 b7c09d68295d86a7a53415790be26cf4635
作者:Greg Finak
日期:2020-12-21 13:02:24 -0800
提交的信息:

合并git.bioconductor的分支“master”:packages/COMPASS
包:指南针
提交:5347 ad3418ff137aabc4d24438a4f0d862599947
作者:Greg Finak
日期:2020-12-21 12:57:43 -0800
提交的信息:

添加选项，只返回数据，而不通过run_model_or_return_data拟合模型
包:指南针
提交:1 de78e4a54f956cdef4ecedd889c3cd0f8815d84
作者:Greg Finak
日期:2020-12-01 13:33:10 -0800
提交的信息:

更新后。R修复#75
包:指南针
提交:8 ed17dd22dc47b47b04e32c0e66fdfadc366a9f5
作者:Greg Finak
日期:2020-11-28 16:04:28 -0800
提交的信息:

更新文档
包:指南针
提交:3 b66fccbbe3d9cf346039573ff3498a2ec99862b
作者:Greg Finak
日期:2020-11-28 16:02:48 -0800
提交的信息:

合并分支'master'的github.com:RGLab/COMPASS到origin_master
包:指南针
提交:7 ba8d3a678b2fca955def43533d58a43413094f5
作者:Greg Finak
日期:2020-11-28 16:01:33 -0800
提交的信息:

通过参数在simpleCOMPASS中设置种子
包:指南针
提交:2 b3ba18b442d1959e47287529eb941b409c8daaf
作者:Mike Jiang
日期:2020-11-15 18:16:49 -0800
提交的信息:

创建build.yml
包:指南针
提交:5305762 ec830c4cb01d4fa86b2533f0991256c0a
作者:Greg Finak
日期:2020-11-06 12:46:36 -0800
提交的信息:

更新.travis.yml
包:指南针
提交:8070 a622688c8b5669b22b2d2f6c51ae5cc6a143
作者:Greg Finak
日期:2020-11-06 10:26:07 -0800
提交的信息:

合并分支“trunk”到origin_master
包:指南针
提交:ef1e4201e2b55e9aa602fdcc64e44332381bb271
作者:Greg Finak
日期:2020-10-02 14:44:26 -0700
提交的信息:

合并原点主
包:指南针
提交:a193762f77193bf2acc92ee90a51fc7935232bb6
作者:Greg Finak
日期:2020-10-01 10:40:17 -0700
提交的信息:

更新.travis.yml
包:指南针
提交:541 aa0abad48cd3eb4522af2a824e5b10dabe91b
作者:Greg Finak
日期:2020-10-01 10:33:00 -0700
提交的信息:

更新.travis.yml
包:指南针
提交:f9a29468c410f5b20c4a221d208155a73b07038a
作者:Greg Finak
日期:2020-10-01 10:02:33 -0700
提交的信息:

更新.travis.yml
包:指南针
提交:d1b833f1693188801a430c5cb94ad201e015328d
作者:Greg Finak
日期:2020-07-03 08:26:23 -0700
提交的信息:

从malisas/plotCOMPASSResultStack_bug合并pull请求#74修复R 4.0中的plotCOMPASSResultStack错误
包:指南针
提交:e7ea689f6bf8fa6163e0b9b22f64d0b2f730286f
作者:malisas
日期:2020-07-02 19:32:59 -0700
提交的信息:

修复r4.0中的plotCOMPASSResultStack错误
包:指南针
提交:24 b68cc1664232eeb59b3a01fc2ca972377d5245
作者:mikejiang
日期:2020-07-02 12:20:14 -0700
提交的信息:

根据最新的gs更新更新测试
包:TraRe
提交:008 f89507c585cc2d2715612266f0f1c88449a91
作者:Jesús de la Fuente Cedeño
日期:2020-12-21 22:00:00 +0100
提交的信息:

描述文件已更改
包:指南针
提交:c803b7a77ffc43eb67849adc20d1d9d6ac2076ff
作者:Greg Finak
日期:2020-12-21 12:57:43 -0800
提交的信息:

添加选项，只返回数据，而不通过run_model_or_return_data拟合模型
包:TraRe
提交:d130556a4f9c1e6feb5a84cf9b3f38db4a362a0f
作者:未知
日期:2020-12-21 21:51:43 +0100
提交的信息:

描述文件已更改
包:TraRe
提交:20391053 f61d58fd6581feedb16887fc002a3c9f
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 21:42:14 +0100
提交的信息:

描述了
包:TraRe
提交:ddecce276614c0024ed4500a1e35f355b056f461
作者:未知
日期:2020-12-21 21:31:06 +0100
提交的信息:

TraRe。Rproj deleted from repository
包:TraRe
提交:f835642cdb2cfef1446253a5bea37504e1197f93
作者:未知
日期:2020-12-21 21:16:59 +0100
提交的信息:

0.99.5
包:GeomxTools
提交:d914164ce3c745bf8a58d20e686b04d2dd0da0f7
作者:NicoleEO
日期:2020-12-21 10:32:26 -0800
提交的信息:

更新版本
包:ChemmineOB
提交:1 b9cb009567aaa98893bb822af67b72ac450ffce
作者:呼兰
日期:2020-12-21 09:37:02 -0800
提交的信息:

修复了propOB错误
包:scPCA
提交:aa0eb2584ae5c093ee89fd19cfbb35d445d4cc30
作者:Philippe Boileau
日期:2020-12-21 09:39:33 -0800
提交的信息:

将ScaledMatrix添加到DESC的Remotes部分
包:砧
提交:0 f32f48b5702b20f37433978d0860802d2a467c0
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-21 11:41:21 -0500
提交的信息:

avtable_page (filterTerm=)可以为零长度
包:ComplexHeatmap
提交:1 a5563af3090e7e389b347e239c31a340858279c
作者:顾祖光
日期:2020-12-21 17:37:32 +0100
提交的信息:

版本撞
包:ComplexHeatmap
提交:46 b5212bbb99b027fb3496efdc1cf12494c0d8ad
作者:顾祖光
日期:2020-12-21 17:03:30 +0100
提交的信息:

将heatmap()移动为私有函数
包:netDx
提交:da3149adb67519abe95d24e9c4cd69e59a07b536
作者:Shraddha Pai
日期:2020-12-21 11:10:11 -0500
提交的信息:

增加了Win-not-supported标志
包:simplifyEnrichment
提交:40 d772553b212cc686c817a374a30b598270a81a
作者:顾祖光
日期:2020-12-21 16:54:48 +0100
提交的信息:

版本撞
包:simplifyEnrichment
提交:e93d5f72fdf1af6d7b1d095846b5d661dfbdf237
作者:顾祖光
日期:2020-12-21 16:53:49 +0100
提交的信息:

在热图列表中添加NULL
包:TraRe
提交:00434 e757dd4430d2d1f70f6a46d5f053ef0efe1
作者:ubioinfo <65729110+ubioinformat@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 16:13:45 +0100
提交的信息:

合并拉请求#14从ubioinfo /dev自述更改
包:TraRe
提交:2 d9bcfac8329cd36d63a4b7ba43b3557d116db37
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 16:12:10 +0100
提交的信息:

自述文件改变
包:TraRe
提交:695 a9c7c91c9e934c392a8c2096edf4de5285957
作者:ubioinfo <65729110+ubioinformat@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 16:02:27 +0100
提交的信息:

修复了ubioinfo /dev gitignore文件中的合并拉请求#13
包:TraRe
提交:5 d2a0397ea75159ba004e81864a1c893a129d0a3
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 15:59:49 +0100
提交的信息:

Rprojuser文件夹更改
包:TraRe
提交:fa0c589d0eca719e15d859f09a163c53ac55c4d2
作者:ubioinfo <65729110+ubioinformat@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 15:46:36 +0100
提交的信息:

合并拉请求#12从ubioinfo /dev版本0.99.4
包:TraRe
提交:a0e08e9588d67d04c93bec67ff57eb5ee573280e
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 15:44:59 +0100
提交的信息:

版本0.99.4
包:TraRe
提交:0 c86af14f67459aee3c8aba992a1536016add205
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 15:29:23 +0100
提交的信息:

Rhistory文件已删除
包:TraRe
提交:14 d18cc3bbb6a39aa4a1e1e41b3ad25774afe6af
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 15:18:14 +0100
提交的信息:

合并完成
包:TraRe
提交:2782 be7ab91229e6f24a02676e137595eb288db2
作者:ubioinfo <65729110+ubioinformat@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 15:08:41 +0100
提交的信息:

合并拉请求#11从ubioinformation /try版本0.99.4
包:TraRe
提交:50 d67760215db6eab7f234f1e4d6124a678add00
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 15:05:15 +0100
提交的信息:

TraRe。Rproj deleted from cache
包:TraRe
提交:1962 c001647634b1e1479d4a61df43a6e17a96c5
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:55:26 +0100
提交的信息:

.gitignore固定
包:TraRe
提交:9 d6412517f5249c1ecbd79c7cfcbdac3ea37a8f6
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:47:08 +0100
提交的信息:

文件更改
包:TraRe
提交:ba6dc0135d46c28bce33c39c41bd272a70f7485f
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:46:35 +0100
提交的信息:

gitignore改变
包:TraRe
提交:0404 b986b23f1737f4b6773f760e46f2d141050f
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:43:48 +0100
提交的信息:

rproj改变
包:TraRe
提交:0 deb7c10beae83aa3b34dcad97a2a8d883f45f33
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:35:49 +0100
提交的信息:

.gitignore修改
包:TraRe
提交:bb07e48c93ccdd3c0f686b6c2866b8ac7ca969ef
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:34:46 +0100
提交的信息:

新的跟踪文件
包:TraRe
提交:be3531d3a28b4b565298b2ac3f9a0dc7110574c8
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:19:18 +0100
提交的信息:

版本0.99.4修正了gitignore
包:TraRe
提交:efad0c708c97dcc37278c828021f53e91803110f
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:18:17 +0100
提交的信息:

gitignore改变
包:TraRe
提交:d673b914725d8de5e29cd739329f6f060bec85a8
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 14:13:25 +0100
提交的信息:

TraRe。Rproj added
包:TraRe
提交:2459773 b37386c6bf7f1c33bd5af0ac12c832abb
作者:ubioinfo <65729110+ubioinformat@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-21 13:30:21 +0100
提交的信息:

合并拉请求#10从ubioinfo /尝试版本0.99.4
包:TraRe
提交:e82da98f071c0fa60585eb2e67042d9c272b7f2c
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 13:29:43 +0100
提交的信息:

描述和新闻更改
包:TraRe
提交:5 dc5280308e26d23b5bd9140a25272ff410afe28
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 13:24:32 +0100
提交的信息:

.Rpoj。从缓存中删除用户
包:TraRe
提交:aaf5c15cbecd6ba36e175ec6a02fb6e3ab124b34
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 13:14:25 +0100
提交的信息:

.Rproj。用户已从gitignore删除
包:TraRe
提交:27 bbd43e7ac67cca778ea32cd5863ec0677eb73d
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 13:12:44 +0100
提交的信息:

gitignore更新
包:TraRe
提交:004122 d10d20dcb59fedd59b997c538230421a68
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 12:57:17 +0100
提交的信息:

.gitignore更新
包:TraRe
提交:0 ad8ffcf60a81f0ce81d6788e0102bf42ef1f454
作者:Jesus de la Fuente Cedeno
日期:2020-12-21 12:49:54 +0100
提交的信息:

类()删除和biocheckgitclone修复
包:TraRe
提交:3 cfb7f941c58adcad571c9b4208617a687a44bae
作者:Jesus de la Fuente
日期:2020-11-13 20:44:22 +0100
提交的信息:

Rhistory更新
包:MAGAR
提交:4 bc68e989a872032f435d6f3a78932a2cc0cce62
作者:Michael Scherer
日期:2020-12-21 11:23:12 +0100
提交的信息:

处理更多评论
包:MAGAR
提交:068300566618 a73f21516f697020ac7e12f06cde
作者:Michael Scherer
日期:2020-12-18 18:06:45 +0100
提交的信息:

添加了表和测试
包:ramr
提交:d05abef7b0b55bdf41ef29e413f1701f8e654682
作者:Oleksii。Nikolaienko < oleksii.nikolaienko@uib.no >
日期:2020-12-21 09:46:11 +0100
提交的信息:

生物导体制备
包:signatureSearch
提交:b247c0e65162c7313af5d7de020b68cbb6265c75
作者:段玉珠
日期:2020-12-21 00:41:30 -0800
提交的信息:

更新恐鸟列表
包:蛇怪
提交:1 e3a76a43fe1f54b394a8a84359a504ba3bfb17a
作者:LTLA
日期:2020-12-21 00:00:07 -0800
提交的信息:

撞的版本。
包:BumpyMatrix
提交:9 e544d1a092f8fa273a8b62b6aa11a5aa6a31c7c
作者:LTLA
日期:2020-12-20 22:38:04 -0800
提交的信息:

增加了一个unsplit方法，以获得原来的DF。
包:BumpyMatrix
提交:63 b7e44793041a3863925f90cf85fe03d55449d4
作者:LTLA
日期:2020-12-20 22:01:07 -0800
提交的信息:

增加了一个redim方法，便于重新组装。
包:SCArray
提交:6 d5db6129df7aa392048f9425397ed00c0432dac
作者:郑秀文
日期:2020-12-21 00:41:13 -0600
提交的信息:

添加extract_sparse_array ()
包:mumosa
提交:54 a1e5b34f2795e39073c05e750984e646c550b7
作者:LTLA
日期:2020-12-20 21:46:17 -0800
提交的信息:

避免翻转秩的冗余计算。
包:mumosa
提交:b8a9ba5f0d730e47953f4706eecee54d40832bb4
作者:LTLA
日期:2020-12-20 12:12:44 -0800
提交的信息:

修正了对bpNotSharedOrUp的调用。
包:MSstatsTMT
提交:f719554991e8653f32aaf29309664758ec50f8c3
作者:黄婷
日期:2020-12-20 23:37:54 -0500
提交的信息:

更新进度条
包:蛇怪
提交:6644737457163 deea08f708f7289eb69588fa772
作者:LTLA
日期:2020-12-20 19:37:03 -0800
提交的信息:

避免在用户的站点包中捡垃圾。
包:蛇怪
提交:ff9ad97f5d104b775e0b2990543f9ca4f9a45f3d
作者:LTLA
日期:2020-12-20 18:44:37 -0800
提交的信息:

停止网商因软件包安装而抱怨。
包:BiocParallel
提交:19 e1e1386f3e616effcd1ba0479ebe2de0dd7875
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-20 17:55:05 -0500
提交的信息:

版本碰撞，命名空间，单元测试和misc手册页更新
包:BiocParallel
提交:7870668 dbf80966b214088f12f296e9dc619ffb4
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-20 17:54:22 -0500
提交的信息:

向bpvalidate()添加警告/错误/静默信号
包:BiocParallel
提交:990618916 e2da77014a39fd8ce573dfc4eb9ffde
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-20 17:49:51 -0500
提交的信息:

添加BPValidate类
包:BiocParallel
提交:cd87d1640859a2e72048c20129288661c08e0573
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-20 17:43:55 -0500
提交的信息:

代码风格
包:BiocParallel
提交:caf539cf5a04d9316a2c95541500e68166787d89
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-20 17:40:09 -0500
提交的信息:

Bpvalidate()首先在定义环境中搜索，然后搜索()——以前，变量会被标记为在全局环境中(错误)，即使它在定义环境中(很好)
包:BiocParallel
提交:20 ee9ffd1fd9a7ab5b98d4a6a64565a1a7c4a75f
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-20 17:36:05 -0500
提交的信息:

Bpvalidate()只适用于单个' library() '或' require() '
包:食物
提交:4839 a150f8320d7994e180b39bfc5386627e16e5
作者:LTLA
日期:2020-12-20 11:54:32 -0800
提交的信息:

修复了使用. bpnotsharedorup的错误。
包:BumpyMatrix
提交:e0e5e7c3373fadb78d7777b51df573faa26fd011
作者:LTLA
日期:2020-12-20 12:07:23 -0800
提交的信息:

为BumpyMatrices添加了一个长度()方法。
包:RiboDiPA
提交:93 b588adba022eaf14549e97a53f45c89d19a8f9
作者:王吉平博士
日期:2020-12-20 06:14:43 -0600
提交的信息:

拷贝字符串
包:limma
提交:cc1e7e2cc775b26b6f03b3dfbda722b9629755b3
作者:Gordon Smyth
日期:2020-12-20 21:48:09 +1100
提交的信息:

limma 3.47.2 - read.idat()现在检查gzip的IDAT文件，如果检测到，会给出一个信息性错误消息。
包:mumosa
提交:e14a65512d3ac466743f93cea8accdff9f11db81
作者:LTLA
日期:2020-12-20 01:21:40 -0800
提交的信息:

增加了一个子集。为SE方法的use.names=添加了更多的命名选项。用NULL替换缺失，以便于编程。
包:mumosa
提交:1 a2d9c2d8a4044f7ae5818c70f60b7ae946abbc2
作者:LTLA
日期:2020-12-19 22:46:02 -0800
提交的信息:

加强块处理以避免过多的内存使用。
包:地球
提交:0 cff7e108d267e813b2b4bd23957af1b67bb8fab
作者:Victor
日期:2020-12-20 00:46:51 -0800
提交的信息:

v0.99.1
包:universalmotif
提交:b4c654d83c415e641103eca7b20bed20c43cbba0
作者:Benjamin Jean-Marie Tremblay
日期:2020-12-20 09:31:58 +0100
提交的信息:

新增trim_motifs(trim.from)选项，修复了MEME版本字符串解析的错误
包:食物
提交:6 e5b7d17f85d1240c4c607bd453b9bbb48d661d3
作者:LTLA
日期:2020-12-19 23:30:38 -0800
提交的信息:

对于稀疏秩矩阵避免全稠密中间体。当输入值为负值时，保持稀疏性。
包:地球
提交:fd25ab5a261f9a43c60af68d5548ec485dfb75c0
作者:Victor
日期:2020-12-19 20:41:17 -0800
提交的信息:

R版本升级到4.1
包:DropletUtils
提交:c71e6bbb37f44729849e0e7c758a3aeabf90246d
作者:LTLA
日期:2020-12-19 15:00:45 -0800
提交的信息:

碰撞版本和日期，更新新闻。
包:DropletUtils
提交:f037f565a55794fbeaf6b7ae47884134e7576633
作者:LTLA
日期:2020-12-19 14:46:32 -0800
提交的信息:

在read10xCounts中并行化数据加载。
包:砧
提交:a321152d7ad7f81b4dffe448015bca87c8d4cf60
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-19 16:51:10 -0500
提交的信息:

URLencode avworkspace_name() -替换curl_escape()，它将'%20'重新编码为'%2520'，等等。
包:InteractiveComplexHeatmap
提交:1 ebcb7a7ff5ded93a8a97087b73d289c99c7b4cf
作者:顾祖光
日期:2020-12-19 20:53:26 +0100
提交的信息:

根据生物检测更新
包:InteractiveComplexHeatmap
提交:d775570a67adc11ae0b47d80e70d5c6a33bd0377
作者:顾祖光
日期:2020-12-19 20:40:49 +0100
提交的信息:

根据生物检测更新
包:InteractiveComplexHeatmap
提交:6 c9b9b8721bf92b5f65e8b4b2509a782d7a2bc4f
作者:顾祖光
日期:2020-12-19 20:40:06 +0100
提交的信息:

根据生物检测更新
包:InteractiveComplexHeatmap
提交:f8176bc6e9a9b66c2ce7350f38a43b04555f4701
作者:顾祖光
日期:2020-12-19 20:36:33 +0100
提交的信息:

根据生物检测更新
包:砧
提交:6 bd6810bf2d7b3b421c32b997419ba97d1cf23ee
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-19 12:03:21 -0500
提交的信息:

缓存gcloud访问令牌以提高性能
包:zellkonverter
提交:320 aa15d61ee2d084bfba0310bddbc547dd1c2a3
作者:Luke Zappia
日期:2020-12-19 10:07:01 +0100
提交的信息:

碰撞版本和更新新闻
包:zellkonverter
提交:94864 b589cce872904eb600d9161645e27d5525d
作者:Luke Zappia
日期:2020-12-19 10:03:49 +0100
提交的信息:

合并分支'master'的github.com:theislab/zellkonverter * 'master'的github.com:theislab/zellkonverter:避免转置减少昏暗。轻易放弃转移HDF5数组。修正了实际传递hdf5_backed的错误。稍微更好的HDF5支持SCE->AnnData转换。使用back ='r'加载更友好的hdf5支持的矩阵。AnnData2SCE将默认保留hdf5支持的状态。精简readH5AD的hdf5支持模式。
包:zellkonverter
提交:5 e3d2ead08008c1f8881f5ec34501f0202f1c2d7
作者:Luke Zappia
日期:2020-12-19 10:03:15 +0100
提交的信息:

改进了对HDF5传输的支持
包:zellkonverter
提交:31 d4b91e7abd7c3426e1daa8819fd11b183921d0
作者:LTLA
日期:2020-12-17 22:47:49 -0800
提交的信息:

避免调换减少暗。
包:zellkonverter
提交:6 fce6183c2a7c5fca22802156d4dfe1e82b05732
作者:LTLA
日期:2020-12-17 22:30:16 -0800
提交的信息:

轻易放弃转移HDF5数组。
包:zellkonverter
提交:59 f0fd58025b5bfe8fb528c5b1a66de685e99dac
作者:LTLA
日期:2020-12-17 21:45:14 -0800
提交的信息:

修正了实际传递hdf5_backed的错误。
包:zellkonverter
提交:fb1f348efc436b0538fb286c2307548bb73ba2c6
作者:LTLA
日期:2020-12-16 23:37:32 -0800
提交的信息:

稍微更好的HDF5支持SCE->AnnData转换。
包:zellkonverter
提交:29847 ebb51fc315b0caba4ffc7c58f5708bed1fc
作者:LTLA
日期:2020-12-16 21:08:17 -0800
提交的信息:

使用back ='r'加载更友好的hdf5支持的矩阵。AnnData2SCE将默认保留hdf5支持的状态。精简readH5AD的hdf5支持模式。
包:zellkonverter
提交:724 ecaab4994200a4ce45ff39a65331bce541cdb
作者:Luke Zappia
日期:2020-12-11 17:36:11 +0100
提交的信息:

向README添加贡献者
包:zellkonverter
提交:f0e60fe2a42134c91c3fd8f087808a99e3fc5e6b
作者:Luke Zappia
日期:2020-12-11 17:29:35 +0100
提交的信息:

将构建状态表添加到README
包:zellkonverter
提交:fbe6b8e6efedceef3eb8bacc2d5164252711957d
作者:Luke Zappia
日期:2020-12-11 17:21:42 +0100
提交的信息:

将logo添加到README
包:BumpyMatrix
提交:40469 f0b0bc23cdd507cb4f8e2fa0dedfa37d2d2
作者:LTLA
日期:2020-12-18 23:37:23 -0800
提交的信息:

不一致的版本和日期。
包:BumpyMatrix
提交:871 f1f2809e18bd7fc36c040b9598e03401143a8
作者:LTLA
日期:2020-12-18 23:33:53 -0800
提交的信息:

修正了矩阵输出的错误，特别是quantile()。
包:systemPipeR
提交:c49963d8ae48deede1bd7116a8fdb58ca22b1194
作者:dcassol
日期:2020-10-30 20:06:52 -0700
提交的信息:

添加新的方法:'addAssay'和'addMetadata'
包:brainflowprobes
提交:629 f3996f698bfc00af7c938f48d3df8f9f18d3b
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 19:52:36 -0500
提交的信息:

v1.5.1—更新到最新的biocthis GHA;用RefManageR替换针织
包:重新计票
提交:3 a46d6bbbd8eff28a5d02040bd1fbf49f27144c4
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 19:46:09 -0500
提交的信息:

现在安装regionReport依赖项
包:regutools
提交:7 a252b0c65553f88f7849a2d7594c3384442f02f
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 19:17:39 -0500
提交的信息:

修复linux上的BiocCheck问题
包:MMUPHin
提交:883786 e4d019ddcf59166645f824b1db57d6033c
作者:马思远
日期:2020-12-18 18:44:52 -0500
提交的信息:

更改电邮地址
包:NanoStringNCTools
提交:7 d83cdedda9150ecaedc746042082b552aac7566
作者:NicoleEO
日期:2020-12-18 15:41:59 -0800
提交的信息:

增加补丁
包:GeomxTools
提交:982 d3bc731fbefd4ccd559af0a71a8322404d2da
作者:NicoleEO
日期:2020-12-18 15:39:24 -0800
提交的信息:

更新补丁号
包:GeomxTools
提交:b98dc5e4f4367a6f8b636b94e1f4bca0b59f6ae1
作者:杨志
日期:2020-12-18 13:44:00 -0800
提交的信息:

为design、design<-和show添加importFrom
包:GeomxTools
提交:b4eb05bd3fedce1e9404ca27679120ace4a91446
作者:杨志
日期:2020-12-18 12:31:13 -0800
提交的信息:

为方法和统计信息添加importFrom
包:NanoStringNCTools
提交:f4d30c6cb8fb1539635bd12e417837d4b7fa6706
作者:NicoleEO
日期:2020-12-18 15:04:36 -0800
提交的信息:

版本撞
包:DelayedArray
提交:134476 e672eb10bc4ab730cc12b364b972102fcf
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-18 15:02:19 -0800
提交的信息:

DelayedUnaryIsoOpStack手册页的一些新增内容
包:砧
提交:7353 ad577e65e326799a222795f10c46c2f37624
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-18 17:44:31 -0500
提交的信息:

版本碰撞和新闻更新
包:砧
提交:4 d1b1e1e98b492cba8ac0a113759731d3c95fc0a
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-18 17:38:21 -0500
提交的信息:

错误修复-返回实体为表+ '_id'列，与GUI显示一致-更好地处理零长度结果(进度条，空tibble) -文档avtable_page ' filterTerms= '
包:砧
提交:18 b0372aab349975fee1d62a307e270792123b48
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-18 16:35:18 -0500
提交的信息:

错误修复-导入bind_cols -转义'name = ' -不要使用' .is_avtable() '，因为检索大量的表是昂贵的-默认情况下对'name'排序(即实体键)
包:砧
提交:e11f6e4a43e65350aeee89cb386270b4a3fef7ad
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-17 16:40:23 -0500
提交的信息:

检查有效的表名;调整进度条到可用资源
包:砧
提交:3 ba738bfdb416d891e2c6dc4c4c7e50e59e65bb7
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-16 11:40:40 -0500
提交的信息:

分页接口avtable_page()的初始迭代
包:OncoSimulR
提交:04 c06401fd1230204d7e0dcf5a7573bdba594cc7
作者:ramon diaz-uriarte (at Phelsuma)
日期:2020-12-18 23:20:58 +0100
提交的信息:

2.99.5
包:ImmuneSpaceR
提交:51 b76482d113ced5b484f23e44d9ba4fdfba4539
作者:jkim2345
日期:2020-12-18 22:09:40 +0000
提交的信息:

凹凸版
包:ImmuneSpaceR
提交:a1bc929049f9c08ea7a1d775a943c14abe58eca4
作者:jkim2345
日期:2020-12-18 22:08:45 +0000
提交的信息:

修复合并问题
包:ImmuneSpaceR
提交:e8ef8fcf0cc281d17529c8a5f9c406117f6bbd76
作者:jkim2345
日期:2020-12-18 21:54:39 +0000
提交的信息:

凹凸版
包:ImmuneSpaceR
提交:28 e25b25249e416463b9f983aebf13001d31d4d4
作者:jkim2345
日期:2020-12-18 21:53:48 +0000
提交的信息:

合并远程跟踪分支“upstream/RELEASE_3_12”
包:ImmuneSpaceR
提交:4 c67316bfd95356f1bcd617f182a0b61b53b315f
作者:海伦·米勒
日期:2020-09-09 18:24:12 -0700
提交的信息:

从RGLab/dev DR35更新合并拉请求#117
包:ImmuneSpaceR
提交:badc90caf29b4ee10c516a40a999d6d58273f582
作者:海伦·米勒
日期:2020-09-09 15:16:01 -0700
提交的信息:

*在可能的地方使用value_preferred(#116) *在可能的地方使用value_preferred *更新elisa测试数据集*更新SDY1328测试期望以反映更新的数据
包:ImmuneSpaceR
提交:a912021320d4442492ef8dfe533292bd26ed2717
作者:ehfhcrc
日期:2020-03-23 14:16:33 -0700
提交的信息:

合并来自RGLab/dev的pull请求#114，在dr33后更新SDY180 NAb数据
包:ImmuneSpaceR
提交:b25ec82ef44e8887b5300c0d4bf60fe2c950cc93
作者:Evan
日期:2020-03-20 14:48:28 -0700
提交的信息:

更新dr33后SDY180 NAb数据
包:砧
提交:8 a98b5537fdc3a3c8ee8b2153764471d6cf55f75
作者:马丁·摩根
日期:2020-12-18 16:37:43 -0500
提交的信息:

更健壮的响应处理-不要使用' fromJSON() '对""(抛出错误)- ' cat(， file = stderr() '文本/html体的输出错误在.avstop_for_status()
包:NanoStringNCTools
提交:ff1d1eb312c96d092154f4d3a713a86c4e5de7b6
作者:NicoleEO
日期:2020-12-18 13:26:49 -0800
提交的信息:

更新版本
包:BumpyMatrix
提交:ac077519da0d00276201d73b6d34753d8028f5fc
作者:LTLA
日期:2020-12-18 13:23:47 -0800
提交的信息:

支持使用不带参数的构造函数。
包:BumpyMatrix
提交:5397 b9c35d837f3cb068dec8fa242e74d355c3ae
作者:LTLA
日期:2020-12-18 13:06:01 -0800
提交的信息:

为保持一致性，将splitTo重命名为splitAs。竟然在小插曲中加入了稀疏的呼唤。
包:NanoStringNCTools
提交:7 e152ffe7afda60d1f72a202391225266a8f724f
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 17:43:36 -0800
提交的信息:

更新补丁版本
包:NanoStringNCTools
提交:c935a04123fc2ff3c897aca1b2d470f6a81406a9
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 17:03:10 -0800
提交的信息:

解决别名
包:NanoStringNCTools
提交:21 d9497e60949668c7eba7cf3c312492c6a7c4c9
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 16:30:08 -0800
提交的信息:

移动方法doc
包:NanoStringNCTools
提交:b5bda73241285e25aabe6ee7a699fd4204f9e7b7
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 16:18:05 -0800
提交的信息:

添加rccset方法
包:NanoStringNCTools
提交:a4ac9a75afb2377235e2d3051ec266ac2bf44b24
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 15:54:39 -0800
提交的信息:

添加qpdf
包:NanoStringNCTools
提交:f8825554b17398e215e310d1c602ffa34b992359
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 15:52:09 -0800
提交的信息:

合并https://github.com/Nanostring-Biostats/NanoStringNCTools的分支“master”
包:NanoStringNCTools
提交:1 fa189caffde54c5645ebc65c223d1693802c4d6
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 15:48:38 -0800
提交的信息:

添加使用方法
包:NanoStringNCTools
提交:bf24578e71363f7b56e56ac81ffa16614475ce20
作者:杨志
日期:2020-12-17 15:44:06 -0800
提交的信息:

将https://github.com/Nanostring-Biostats/NanoStringNCTools的分支'master'合并为master
包:NanoStringNCTools
提交:d81dfc15e463134fb1b816097bff23da3442b601
作者:杨志
日期:2020-12-17 15:43:58 -0800
提交的信息:

协调tooltipID的默认值
包:NanoStringNCTools
提交:5 cbdd5c0dfe204f9b7ede00cc9bee99297f15893
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 15:43:06 -0800
提交的信息:

移动rccset参数
包:NanoStringNCTools
提交:17833 ce838f17fce01542dd6cdb7e6a41dc7ed95
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 15:30:01 -0800
提交的信息:

Rccset特定参数移动
包:NanoStringNCTools
提交:81 b5cf7fdab14829827a50490454948700bc71b5
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 15:25:46 -0800
提交的信息:

修复dimlabel警告
包:NanoStringNCTools
提交:af04af893d09ed1fea8b06fcc4a698b7b131518f
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 14:51:02 -0800
提交的信息:

解决代码文档不匹配问题
包:NanoStringNCTools
提交:f3f5e1452d3e6ff1d2d35a94f280e41941fe98b9
作者:David Henderson
日期:2020-12-17 14:38:09 -0800
提交的信息:

添加泛型
包:NanoStringNCTools
提交:c860db98c4e45e803a12ce077adc13a8b2f66843
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 14:18:44 -0800
提交的信息:

解决不匹配
包:NanoStringNCTools
提交:0264 dbf282676d0dbc2508cf995e0106c7037ac8
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 14:11:40 -0800
提交的信息:

合并https://github.com/Nanostring-Biostats/NanoStringNCTools的分支“master”
包:NanoStringNCTools
提交:deafc8925745d77c554cc26dec8e6fbb1d194cd9
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 14:11:04 -0800
提交的信息:

添加未记录的对象和方法
包:NanoStringNCTools
提交:b49a907dcd1a09a3e7687aea6a56ed7c6747445a
作者:杨志
日期:2020-12-17 13:35:52 -0800
提交的信息:

将分支“zyang”合并到master中
包:NanoStringNCTools
提交:c8364dc145c9e4566012cebf5e09f80b72321864
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 13:28:47 -0800
提交的信息:

向文档中添加方法
包:NanoStringNCTools
提交:1 a4e47ed40d46420c4826e477c63dc589ee17dcf
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 13:08:43 -0800
提交的信息:

为man添加sigset参数
包:NanoStringNCTools
提交:fc747ce1a070e18f3d8179285ceb180e05525381
作者:NicoleEO
日期:2020-12-17 12:57:07 -0800
提交的信息:

修复替换
包:NanoStringNCTools
提交:bdf5d75b033eb9289e17914cbea40cf28c2ce3e2
作者:杨志
日期:2020-12-17 11:52:18 -0800
提交的信息:

将分支“master”合并为zyang
包:NanoStringNCTools
提交:2 f8e2e5072af6a80219817b3c399119c144c8918
作者:David Henderson
日期:2020-12-17 11:48:49 -0800
提交的信息:

延长描述
包:NanoStringNCTools
提交:1957422457 c138af5599268fb0aa7dd1c715537c
作者:杨志
日期:2020-12-17 11:45:53 -0800
提交的信息:

解决了检查Rd \usage部分的问题
包:NanoStringNCTools
提交:e9e0f9bde366415a88b5e2b2ed2de3758d305306
作者:杨志
日期:2020-12-17 11:35:47 -0800
提交的信息:

修复Rd文件和Rd元数据的警告。
包:NanoStringNCTools
提交:473046473 b2df102ac4604023574e11e6ae51ce6
作者:rvitancol <55164869+rvitancol@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-17 09:06:20 -0800
提交的信息:

合并来自Nanostring-Biostats/rona的拉请求#4，删除带有签名的测试
包:NanoStringNCTools
提交:6 cce6bd083c217dcb886893ba5c13960d87ec500
作者:rvitancol
日期:2020-12-17 16:21:40 +0000
提交的信息:

删除带有签名的测试
包:NanoStringNCTools
提交:e3667a120568226d161bf4ada10bd87886f2fef4
作者:rvitancol <55164869+rvitancol@users.noreply.github.com>
日期:2020-12-16 22:19:39 -0800
提交的信息:

通过使用authors@R合并Nanostring-Biostats/zyang修复#1的拉请求#2
包:NanoStringNCTools
提交:0 b9539cb95eafaff7ffa8026ce910b4d656f7587
作者:杨志
日期:2020-12-16 21:34:13 -0800
提交的信息:

通过使用authors@R修复#1
包:regutools
提交:37137 a7960456fab4fa64eb22e9062fbf4437ab7
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 14:23:30 -0500
提交的信息:

从围嘴上取下针织衫
包:IRanges
提交:98 fa949fdb867cc2f38fdc9305f0e692ab3c3f17
作者:Michael Lawrence
日期:2020-12-18 10:37:44 -0800
提交的信息:

分位数，AtomicList总是返回一个矩阵(修复#33)
包:Biostrings
提交:4 f9031a1bc0e102148060cd39aa441d812d75ce7
作者:Hervé Pagès
日期:2020-12-18 10:30:42 -0800
提交的信息:

小编辑(主要是格式化)+版本碰撞
包:regutools
提交:796 bc6400d5d65e403b5315f270e96cc8ca992cf
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 13:17:48 -0500
提交的信息:

v1.3.3—更新到最新的biocthis GHA;用RefManageR替换针织
包:regutools
提交:f263371aae5543805d94aff34f7f722661706cbd
作者:Joselyn Chavez
日期:2020-12-07 02:20:58 -0600
提交的信息:

升级regtools版本1.3.1 -> 1.3.2
包:regutools
提交:082357 f3d968ef937bbc0c5aaa3f0c31b0f5730c
作者:Joselyn Chavez
日期:2020-12-07 02:02:35 -0600
提交的信息:

regulondb 10.6 -> 10.8版本升级
包:derfinder
提交:e9a7ef2c79fd22167ff2bb176a95b75582341163
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 13:02:42 -0500
提交的信息:

v1.25.2 - bump R版本，以确保Bioc在https://master.bioconductor.org/checkResults/3.12/bioc-LATEST/derfinder/malbec1-buildsrc.html(和devel)使用最新的信息
包:regionReport
提交:6 ca98e9cd8615076ef68c09cc8ef7f4e1775c9bc
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 12:59:23 -0500
提交的信息:

v1.25.2—更新pasilla代码，因为DESeq在Bioconductor中不再可用
包:重新计票
提交:eebe44bf7a9c92138a6db70225d96421ee1db4f7
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 12:23:23 -0500
提交的信息:

禁用一些不适用于此包的biocchecking
包:RiboDiPA
提交:36086 db257922c170e1313810d8595a388a2444e
作者:王吉平博士
日期:2020-12-18 10:57:33 -0600
提交的信息:

版本撞
包:Biostrings
提交:a641e117cc383c73987641515556210256c5bcb7
作者:digitalwright
日期:2020-12-18 11:51:56 -0500
提交的信息:

findPalindromes - min. looplth并允许。*更新findPalindromes。R* Update find_palindromes.c * Update R_init_Biostrings.c * Update Biostrings.h * Update findPalindromes.Rd * Update DESCRIPTION * Update findPalindromes.R * Update findPalindromes.R * Update test_findPalindromes.R * Update find_palindromes.c * Update findPalindromes.R * Update find_palindromes.c * Update R_init_Biostrings.c * Update Biostrings.h * Update findPalindromes.R * Update find_palindromes.c * Update Biostrings.h * Update R_init_Biostrings.c * Update findPalindromes.Rd * Update findPalindromes.R
包:RiboDiPA
提交:47 f5c3919956bfb90064147e3db619bece948d9b
作者:王吉平博士
日期:2020-12-18 10:22:31 -0600
提交的信息:

版本撞
包:recountWorkflow
提交:262 b1acc3f7793eeff638d85ebd5b504da615467
作者:Leonardo Collado Torres
日期:2020-12-18 10:59:21 -0500
提交的信息:

还要安装regionReport依赖项
包:LRcell
提交:2 f9d5802213d65b35ad548a17e9df73acc785203
作者:MarvinQuiet
日期:2020-12-18 10:36:14 -0500
提交的信息:

将两个包依赖项更改为R>=4.1
包:LRcellTypeMarkers
提交:73 d06f4a12b01817672ed031e95446b76eff3eec
作者:MarvinQuiet
日期:2020-12-18 10:35:46 -0500
提交的信息:

将依赖项更改为R>=4.1
包:TCGAbiolinks
提交:7 e62bd480a4c9c6858a36f81e39f4077027d6776
作者:Tiago Chedraoui Silva
日期:2020-12-18 10:07:17 -0500
提交的信息:

' as_data_frame() '已弃用。关闭# 439
包:RiboDiPA
提交:a3428dc20865fedbde24835c2ea67ffa0c02453c
作者:王吉平博士
日期:2020-12-18 07:56:09 -0600
提交的信息:

描述
包:MsCoreUtils
提交:a02c1380cc57ad9123728ac1f8a31a958a3d0d66
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-18 14:29:33 +0100
提交的信息:

添加impute_fun示例
包:MsCoreUtils
提交:5 ddb03441627990575af6ed26d4e871508b5464e
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-18 13:44:13 +0100
提交的信息:

合并分支“主”的github.com: rformassspectral /MsCoreUtils
包:MsCoreUtils
提交:3 d32c8490b0995f76ef86fc9c2961909a7ae4bdf
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-18 13:42:08 +0100
提交的信息:

文档:修复文档问题
包:MsCoreUtils
提交:46 da5edb11b29a6f3468a441048acbaf7adb2481
作者:Laurent Gatto
日期:2020-12-17 19:24:35 +0100
提交的信息:

专长:允许输入用户提供的功能
包:MsCoreUtils
提交:bf2a60eedd541ec4293121033cb0421a7c183fa3
作者:Sebastian Gibb
日期:2020-11-02 13:13:33 +0100
提交的信息:

样式:固定缩进
包:MsCoreUtils
提交:4 fff29985df223b203542096e9aac15ea9b822ea
作者:Laurent Gatto
日期:2020-11-02 13:04:44 +0100
提交的信息:

合并拉请求#77从lgatto/master专长:rt2numeric()和rt2character()

源代码和构建报告»

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开发版»

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