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生物导体
BioConductor项目的使命是开发，支持和传播免费的免费开源软件，以促进对当前和新兴生物学测定的数据进行严格且可重现的分析。我们致力于建立一个多样化，协作和热情的开发人员和数据科学家社区。bob电竞体育官网
释放和核心发展
这生物导体发行版每年更新两次，适合大多数用户。还有一个开发版本，将新功能和软件包添加到发行版中。大批元数据包提供途径，有机体，微阵列和其他注释。
这生物导体项目始于2001年，由核心团队，主要基于罗斯威尔公园综合癌症中心，以及来自我们和国际机构的其他成员。一个社区顾问委员会和技术咨询委员会关键参与者每月开会以支持生物导体通过协调培训和推广活动，制定策略来确保核心基础设施的长期技术适合性，并确定和启用长期可行性的资金策略。一个科学顾问委员会包括外部专家提供的年度指导和问责制。
该项目的主要引用包括Huber等人，2015年自然方法12：115-121and绅士等，2004基因组生物学5：R80
生物导体软件包
最多生物导体组件分配为r软件包。功能范围生物导管包包括对DNA微阵列，序列，流，SNP和其他数据的分析。
项目目标
广泛的目标生物导体项目是：
- 为了提供广泛的访问，以分析基因组数据的广泛强大的统计和图形方法。
- 为了促进将生物元数据纳入基因组数据的分析，例如来自PubMed的文献数据，Entrez基因的注释数据。
- 提供一个通用的软件平台，以实现可扩展，可扩展和可互操作的软件的快速开发和部署。
- 通过产生高质量的进一步科学理解文档和可再现的研究。
- 至bob app下载 用于分析基因组数据的计算和统计方法的研究人员。
主要项目功能
- R统计计算项目。使用r为生物导体项目，包括：
- 一种高级解释的语言，可以轻松，快速地原型新计算方法。
- 一个完善的系统，用于包装软件和文档。
- 一个面向对象的框架，用于解决计算生物学和生物信息学问题的多样性和复杂性。
- 访问在线计算生物学和生物信息学数据。
- 支持丰富的统计模拟和建模活动。
- 尖端数据和模型可视化功能。
- 由专门的研究人员团队积极发展，对良好的文档和软件设计做出了坚定的承诺。
文档和可再现研究。每个生物导体包包含一个或多个小插图，提供有关软件包功能的文本，面向任务的描述的文档。小插曲有几种形式。许多人是“ howto”，证明了如何使用该软件包的软件完成特定任务。其他人则提供了对软件包的更详细概述或讨论与软件包相关的一般问题。
统计和图形方法。这生物导体项目提供了对基因组数据分析的强大统计和图形方法的访问。分析软件包地址工作流程为了分析寡核苷酸阵列，序列分析，流式细胞仪。和其他高通量基因组数据。这R软件包系统本身为广泛的最先进的统计技术和图形技术提供了实现，包括线性和非线性建模，聚类分析，预测，重新采样，生存分析和时间序列分析。
注解。这生物导体项目提供了用于将微阵列和其他基因组数据与Web数据库的生物元数据相关联的软件，例如GenBank，Entrez基因和PubMed（注释包裹）。还提供了将统计分析结果纳入HTML报告中的功能，并链接到注释Web资源。软件工具可用于组装和处理基因组注释数据，来自GenBank，Gene Ontology Consortium，Entrez基因，Unigene，UCSC人类基因组项目（AnnotationDbi包裹）。注释数据包分布分布以在不同的探针标识符之间提供映射（例如，Affy ID，Entrez基因，PubMed）。定制注释库也可以组装。
生物导体短期课程。这生物导体项目已经开发了一个计划bob app下载 关于用于分析基因组数据的软件和统计方法。为具有生物学或统计的背景的受众提供了课程。全部bob app下载 （讲座和计算机实验室）可在此网站上找到。
- 开源。这生物导体项目对完整的开源纪律有承诺，并通过公共git（版本控制）服务器进行分发。几乎所有贡献都存在于开源许可下。开源软件有益于微阵列数据分析和一般计算生物学的原因有很多不同的原因。原因包括：
- 提供完全访问算法及其实施
- 通过错误修复和软件扩展来促进软件改进
- 通过提供适当的工具和指导来鼓励良好的科学计算和统计实践
- 提供工具的工作台，使研究人员能够探索和扩展用于分析生物数据的方法
- 确保国际科学界是进行研究所需的软件工具的所有者
- 领导和鼓励商业支持和开发成功的工具
- 通过提供开放和可访问的工具来促进可重复的研究，以进行研究（可再现的研究与独立验证不同）
- 公开发展。鼓励用户通过贡献来成为开发人员bob电竞体育官网符合生物导体的包裹或文档。此外生物导体提供了一种将不同的小组与共同目标联系在一起的机制，以促进软件协作，通常是在共享开发层面上。
行为守则
请参考生物导体行为守则
